公司擅自罚款主要违反了《中华人民共和国劳动合同法》以及《工资支付暂行规定》中的相关规定。具体分析如下：

1. 违反《中华人民共和国劳动合同法》：

   • 根据《劳动合同法》第九条，用人单位招用劳动者，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。虽然该条款未直接提及“罚款”，但“以其他名义向劳动者收取财物”可以理解为包括未经合法程序擅自对员工进行罚款的行为。
   • 更重要的是，罚款通常被视为对员工权益的一种剥夺，而《劳动合同法》旨在保护劳动者的合法权益，确保劳动合同的公平、公正执行。因此，公司擅自罚款可能构成对劳动者权益的侵害，违反了劳动合同法的立法精神。

2. 违反《工资支付暂行规定》：

   • 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 这一条款明确规定了用人单位在何种情况下可以扣除劳动者工资，以及扣除的比例和限制。公司擅自罚款，尤其是未经合法程序、未与劳动者协商一致的情况下，直接扣除劳动者工资作为罚款，显然违反了这一规定。

额外说明：

• 公司若要对员工进行罚款，必须基于合法、合理的规章制度，且这些规章制度必须经过民主程序制定、公示或告知劳动者，并确保不违反国家法律、行政法规及政策规定。
• 罚款不是一种常规的、合法的员工管理手段。公司应更倾向于通过正面激励、培训、沟通等方式来提升员工的工作表现和遵守规章制度。

建议：

• 如果您作为劳动者遇到了公司擅自罚款的情况，首先可以与公司进行沟通，了解罚款的原因和依据，并要求公司出示相关的规章制度。
• 如果公司无法提供合法、合理的依据，或者您认为公司的罚款行为违反了相关法律法规，您可以向当地的劳动监察部门投诉，或者寻求法律援助来维护自己的合法权益。