针对您提出的“误工证明休息时间短于鉴定的误工期怎么算”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，误工费鉴定中的休息期（即误工期限）的确定是一个综合考量多方面因素的过程，它旨在确保受害人因伤害导致的收入损失能够得到合理补偿。在这个过程中，主要会参考《人身损害误工期、护理期、营养期评定规范》以及地方司法文件，同时结合受害人的具体伤情、治疗情况、恢复状况等因素进行综合判断。

现在，针对您提出的具体问题，即误工证明上的休息时间短于鉴定的误工期，我们可以从以下几个方面进行分析：

1. 以鉴定结果为准：

   • 在大多数情况下，如果鉴定机构出具的误工期鉴定结果长于误工证明上的休息时间，那么通常会以鉴定结果为准。因为鉴定机构在出具鉴定意见时，会综合考虑受害人的伤情、治疗情况、恢复状况等多方面因素，其鉴定结果相对更为客观、公正。

2. 分析差异原因：

   • 如果误工证明上的休息时间与鉴定结果存在差异，我们需要进一步分析差异的原因。可能是误工证明上的休息时间未能充分反映受害人的实际恢复情况，或者是鉴定机构在鉴定过程中考虑了更多因素（如并发症、后遗症等）导致的误工期延长。

3. 结合实际情况进行判断：

   • 在处理此类问题时，我们还需要结合受害人的实际情况进行判断。例如，如果受害人确实因为伤害导致了较长时间的误工，且鉴定机构也出具了相应的鉴定意见，那么即使误工证明上的休息时间较短，也应以鉴定意见为准来计算误工费。

4. 法律程序与证据规则：

   • 从法律程序的角度来看，如果双方对误工期的确定存在争议，可以通过法律途径进行解决。在诉讼过程中，法院会根据双方提供的证据（包括误工证明、鉴定意见等）进行综合判断，并作出公正的裁决。

5. 操作建议：

   • 对于受害人而言，如果误工证明上的休息时间短于鉴定结果，建议及时与鉴定机构沟通，了解鉴定结果的依据和理由，并保留好相关证据（如医疗记录、诊断证明等）。
   • 如果双方无法就误工期的确定达成一致意见，可以考虑通过法律途径进行解决，并寻求专业律师的帮助。

综上所述，当误工证明上的休息时间短于鉴定的误工期时，我们应以鉴定结果为准来计算误工费，并结合受害人的实际情况和法律程序进行综合判断和处理。希望以上解答能够对您有所帮助。