认证主体与开票主体不符是否违法需分情况讨论，具体结论如下：

1. 若认证主体与开票主体存在关联关系且符合税法规定，通常不违法
   根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务或从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项时，收款方应向付款方开具发票。若认证主体（如品牌授权方）与开票主体（如被授权经销商）存在合法授权关系，且开票行为符合税务机关对“三流一致”（合同流、资金流、货物流）的实质要求，则不构成违法。例如：A公司授权B公司销售其产品，B公司以自身名义开具发票，但合同、资金、货物均由B公司实际履行，此时开票主体与认证主体不符具有合法性。

2. 若认证主体与开票主体无合法关联或存在虚开发票行为，则构成违法
   根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条，任何单位和个人不得为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，不得让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票。若认证主体（如未实际经营的公司）与开票主体（如第三方公司）无真实交易背景，或通过虚构交易、资金空转等方式开具发票，则可能涉嫌虚开发票罪（《刑法》第二百零五条），需承担刑事责任。例如：C公司未实际采购货物，却要求D公司为其开具增值税专用发票，用于抵扣税款，此行为即属违法。

3. 特殊场景下的合规要求
   在集团企业内部，若母公司授权子公司以母公司名义开展业务并开具发票，需满足以下条件：

   • 母公司与子公司存在合法控股关系；
     
   • 业务实质由母公司控制，子公司仅作为执行主体；
     
   • 税务机关对集团企业开票模式有明确备案或认可。
     若未满足上述条件，仍可能被认定为“开票主体与实际经营主体不符”，面临税务处罚。

建议：若您遇到认证主体与开票主体不符的情况，需首先核查双方是否存在合法关联关系（如授权协议、控股关系等），并确保交易真实、资金流向清晰、货物或服务交付符合合同约定。若存在不确定性，可直接向我咨询具体场景下的合规风险及应对方案。