农村12种违法用地的处罚需根据具体违法情形，结合《土地管理法》《土地管理法实施条例》等法律法规综合判定，常见处罚方式包括责令退还、限期拆除、罚款、没收违法所得、恢复原状、追究刑事责任等。以下结合农村常见违法用地类型，分情况说明处罚规则：
一、非法占用土地类（最常见）
未经批准或骗取批准占用土地
- 处罚：责令退还非法占用的土地；对违反土地利用总体规划的，限期拆除新建建筑物并恢复土地原状；对符合规划的，没收新建建筑物并可处罚款（按非法占用土地面积，耕地处每平方米1000元以下罚款，其他土地处每平方米500元以下罚款）。
- 依据：《土地管理法》第77条、第79条。
农村村民非法占用土地建住宅
- 处罚：责令退还土地，限期拆除新建房屋；逾期不拆的，由乡镇政府或县级自然资源部门依法拆除。
- 依据：《土地管理法》第78条（注意：此条仅针对“一户一宅”超占或非本村集体成员建房，若涉及耕地保护可能叠加其他处罚）。
二、破坏耕地类
占用耕地建窑、建坟或建房等破坏种植条件
- 处罚：责令限期改正或治理，恢复原种植条件；可并处罚款（耕地开垦费的2-5倍，一般每亩1万-10万元）；构成犯罪的（如非法占用基本农田5亩以上或一般耕地10亩以上），追究刑事责任（非法占用农用地罪）。
- 依据：《土地管理法》第75条、《刑法》第342条。
因开发土地造成土地荒漠化、盐渍化
- 处罚：责令限期改正或治理；逾期不改正的，责令缴纳复垦费（由政府代为治理），并处罚款（标准同上）。
- 依据：《土地管理法》第76条。
三、买卖或非法转让土地类
买卖或以其他形式非法转让土地
- 处罚：没收违法所得；对违反规划的，限期拆除建筑物并恢复土地原状；对符合规划的，没收建筑物；可并处罚款（违法所得的50%以下）；对直接责任人员依法给予处分。
- 依据：《土地管理法》第74条。
擅自将农民集体所有土地通过出让、转让使用权用于非农业建设
- 处罚：同上，且需注意此类行为常伴随“以租代征”问题，可能涉及合同无效。
- 依据：《土地管理法》第82条。
四、临时用地违法类
- 临时用地期满拒不归还
- 处罚：责令交还土地，处以罚款（每平方米100-500元）。
- 依据：《土地管理法》第57条、第81条。
五、其他特殊情形
拒不履行土地复垦义务
- 处罚：责令限期改正；逾期不改正的，责令缴纳复垦费（由政府代为复垦），并处罚款（每亩1000-5000元）。
- 依据：《土地管理法》第76条。
不按批准用途使用土地
- 处罚：责令交还土地；对擅自改变农用地用途的，按非法占用土地处罚（如将耕地改为养殖场未审批）。
- 依据：《土地管理法》第81条。
在临时用地上建永久性建筑物
- 处罚：责令限期拆除，恢复土地原状；逾期不拆的，依法强制拆除。
- 依据：《土地管理法实施条例》第52条。
违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地
- 处罚：限期拆除新建建筑物，恢复土地原状；对符合规划的，没收建筑物并罚款。
- 依据：《土地管理法》第77条。
阻碍自然资源部门依法执行职务
- 处罚：由公安机关依法给予治安管理处罚；构成犯罪的（如暴力抗法），追究刑事责任。
- 依据：《土地管理法》第78条、《治安管理处罚法》第50条。
关键提醒：
- 处罚主体：县级以上自然资源部门（部分情形如农村村民建房由乡镇政府直接查处）。
- 程序要求：处罚前需履行调查、告知、听证等程序，确保当事人权利。
- 救济途径：对处罚不服的，可申请行政复议或提起行政诉讼。
若涉及具体案件（如占用土地面积、土地类型、是否涉及基本农田等），建议提供详细信息以便进一步分析。