结论：超市特价水果发霉，消费者能否获得1000元赔偿，需根据具体情况判断，主要依据是《中华人民共和国食品安全法》的相关规定。

分析说明：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国食品安全法》第一百四十八条第二款规定，生产不符合食品安全标准的食品或者经营明知是不符合食品安全标准的食品，消费者除要求赔偿损失外，还可以向生产者或者经营者要求支付价款十倍或者损失三倍的赔偿金；增加赔偿的金额不足一千元的，为一千元。但是，食品的标签、说明书存在不影响食品安全且不会对消费者造成误导的瑕疵的除外。

2. 赔偿条件：

   • 水果发霉属于不符合食品安全标准：发霉的水果显然不符合食品安全标准，因为它们可能含有有害微生物或毒素，对消费者健康构成威胁。
   • 超市是否明知：若超市明知水果发霉仍出售，则需承担赔偿责任。若超市不知情，但根据一般商业惯例和合理注意义务，超市应当对销售的食品进行必要的检查，以确保其符合食品安全标准。若超市未尽到这一义务，也可能被视为“明知”。
   • 赔偿金额的计算：根据法律规定，赔偿金额可以是购买价款的十倍或者损失的三倍，以较高者为准。如果计算出的赔偿金额不足1000元，则按1000元赔偿。

3. 实际操作建议：

   • 保留证据：消费者在购买到发霉水果后，应保留好购物小票、水果照片等证据，以便在维权时使用。
   • 与超市协商：首先可以尝试与超市协商解决，要求超市按照法律规定进行赔偿。
   • 向相关部门投诉：如果协商无果，可以向当地的市场监督管理部门或消费者协会投诉，寻求帮助。
   • 提起诉讼：在必要时，消费者还可以向法院提起诉讼，要求超市承担赔偿责任。

特殊场景：

• 如果超市能够证明其已经尽到了合理的检查义务，且水果发霉是由于不可抗力或消费者自身原因造成的，那么超市可能不需要承担赔偿责任。但在实际操作中，这种证明往往比较困难。

行动建议：

• 如果您遇到了超市特价水果发霉的情况，建议您首先保留好相关证据，然后与超市协商解决。如果协商无果，您可以向相关部门投诉或提起诉讼来维护自己的合法权益。如果您在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。