合同丢失的情况下，个税缴纳记录可以作为证明劳动关系存在的证据之一，但通常需要结合其他证据形成完整的证据链。以下是具体分析：

1. 个税缴纳记录的证明力
   根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号），工资支付凭证、社保缴纳记录、工作证等均可作为劳动关系证明材料。个税申报记录（如个人所得税APP中的“收入纳税明细”）属于工资支付凭证的间接证据，能证明用人单位曾向你支付工资并代扣代缴个税，从而间接证明劳动关系存在。但需注意：

   • 若个税记录显示“劳务报酬”而非“工资薪金”，可能被认定为劳务关系而非劳动关系；
     
   • 需确保个税记录中的“扣缴义务人”（即用人单位名称）与实际工作单位一致。

2. 需补充的其他证据
   个税记录单独使用证明力较弱，建议结合以下证据形成完整链条：

   • 工作痕迹证据：如考勤记录、工作群聊天记录、邮件往来、工牌工服、门禁卡等；
     
   • 同事证言：同事的书面证言或出庭作证；
     
   • 社保记录：用人单位为你缴纳社保的记录（可通过社保局官网或APP查询）；
     
   • 银行流水：用人单位定期转账工资的记录（需备注“工资”或“代发工资”）；
     
   • 其他书面材料：如录用通知、转正申请、奖惩通知等。

3. 特殊情况处理

   • 若用人单位否认劳动关系，可向劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁，仲裁机构会综合全案证据判断；
     
   • 若个税记录与实际劳动关系不符（如被冒用身份报税），需向税务机关举报并要求更正，同时保留举报记录作为证据。

行动建议：

1. 立即登录个人所得税APP，下载近1-2年的“收入纳税明细”，重点核对“扣缴义务人”名称和“所得项目”（需为“工资薪金”）；
   
2. 同步收集其他辅助证据（如银行流水、工作记录等）；
   
3. 若用人单位拒绝配合，可携带现有证据向劳动仲裁委员会申请仲裁，主张确认劳动关系。
   

如有进一步疑问或需协助整理证据，可直接向我咨询。