在民事诉讼中，企业注册地和主要办事机构所在地不一致的，应向企业主要办事机构所在地法院提起诉讼。具体分析如下：

1. 法律规定：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二十二条第二款以及《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第三条的规定，对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。而法人或者其他组织的住所地是指法人或者其他组织的主要办事机构所在地。若法人或者其他组织的主要办事机构所在地不能确定的，则以其注册地或者登记地为住所地。

2. 实务操作：

   • 在诉讼过程中，若原告能提供充分证据证明被告的主要办事机构所在地，则法院通常会以该主要办事机构所在地作为管辖依据。
   • 若原告无法提供充分证据，或被告的主要办事机构所在地确实难以确定，则法院可能会依据被告的注册地或者登记地来确定管辖法院。

3. 证据收集：为确保诉讼的顺利进行，原告在提起诉讼前应尽可能收集有关被告主要办事机构所在地的证据，如办公场所的租赁合同、物业证明、员工社保缴纳记录等。

4. 特殊情况：若涉及合同纠纷，且合同中明确约定了管辖法院，则应按照合同约定来确定管辖法院，无论该约定是否与被告的主要办事机构所在地或注册地一致。

在民事诉讼中，若遇到企业注册地和主要办事机构所在地不一致的情况，应优先向企业主要办事机构所在地法院提起诉讼，并尽可能收集相关证据以支持自己的主张。如有进一步疑问，可直接向我咨询。