企业是否有权扣合规费用，需视具体情况而定，但总体原则是企业不能随意扣减员工或合作方的费用，必须基于合法、合规及合同约定的理由。以下从不同角度为您详细分析：
一、企业与员工之间的费用扣减
劳动合同及规章制度：
- 企业与员工签订的劳动合同中，应明确约定工资构成、支付方式及扣减条件。若合同中有明确规定，且该规定不违反法律法规的强制性规定，企业有权按照合同约定扣减相关费用。
- 企业的规章制度也是判断费用扣减是否合法的重要依据。规章制度需经民主程序制定，且内容合法、合理，并已向员工公示或告知。若规章制度中规定了合法的扣减情形，企业可据此操作。
法定扣减情形：
- 根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，企业可在特定情况下扣减员工工资，如代扣代缴个人所得税、社会保险费、住房公积金等法定费用，以及因员工本人原因给企业造成经济损失的赔偿等。
- 但需注意，扣减比例需符合法律规定，且不得超过员工当月工资的20%（若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付）。
非法扣减的后果：
- 若企业无正当理由扣减员工费用，或扣减比例超过法定限额，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求企业补发工资并支付赔偿金。
二、企业与合作方之间的费用扣减
合同约定：
- 企业与合作方签订的合同中，应明确约定费用支付方式、时间及扣减条件。若合同中有明确规定，且该规定不违反法律法规的强制性规定，企业有权按照合同约定扣减相关费用。
法定情形：
- 在某些特定情况下，如合作方违约、未履行合同义务等，企业可能根据法律规定或合同约定扣减部分费用作为违约金或赔偿金。
- 但需注意，扣减的费用需与违约行为或损失程度相适应，且不得违反法律法规的强制性规定。
争议解决：
- 若企业与合作方在费用扣减问题上产生争议，可通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决。在争议解决过程中，双方需提供充分证据证明自己的主张。
三、合规性建议
完善合同及规章制度：
- 企业应制定完善的劳动合同和规章制度，明确费用支付、扣减等条款，确保合法合规。
加强沟通与协商：
- 在涉及费用扣减问题时，企业应与合作方或员工进行充分沟通与协商，尽量达成一致意见，避免产生不必要的争议。
依法维权：
- 若企业认为自己的合法权益受到侵害，应及时收集证据并依法维权，通过合法途径解决争议。
总结来说，企业是否有权扣合规费用取决于具体情况，包括合同约定、法律法规规定以及实际履行情况等。在处理此类问题时，企业应遵循合法、合规及合同约定的原则，确保自身行为的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。