若补偿安置协议中补偿标准适用不当，可通过以下途径处理：

1. 协商解决
   首先可尝试与协议相对方（如征收方、开发商等）协商，明确指出补偿标准适用不当的具体依据（如未依据法定标准、未考虑特殊情形等），要求重新协商补偿方案。协商时需保留书面沟通记录（如邮件、函件），避免口头协商无据可查。

2. 申请行政复议（针对行政协议）
   若协议属于行政机关与公民签订的行政协议（如征收补偿协议），可依据《行政复议法》在知道补偿标准问题后60日内向上一级行政机关申请复议，要求撤销或变更原补偿标准。复议机关需在60日内作出决定，复议期间原则上不停止执行原协议。

3. 提起行政诉讼或民事诉讼

   • 行政诉讼：若协议为行政协议且复议未解决争议，可在收到复议决定后15日内或复议期满后15日内向法院起诉，请求法院判决撤销或变更补偿标准。法院将审查补偿标准是否合法、合理（如是否低于市场价、是否未考虑被征收房屋的特殊价值等）。
     
   • 民事诉讼：若协议为平等主体间的民事合同（如拆迁补偿协议），可直接向法院起诉主张违约责任或撤销协议，需证明补偿标准显失公平（如低于同类地区补偿标准30%以上）或存在重大误解。

4. 申请司法鉴定或评估
   在诉讼中，可申请法院委托专业机构对被补偿财产（如房屋、土地）的市场价值进行鉴定，以证明原补偿标准明显低于实际价值。鉴定结论将作为法院调整补偿标准的重要依据。

5. 要求赔偿损失
   若因补偿标准适用不当导致实际损失（如被迫接受低价补偿后另行购房的差价损失），可在诉讼中一并主张赔偿，需提供损失计算依据（如购房合同、评估报告等）。

关键注意事项：

• 时效性：行政复议需在知道问题后60日内提出，行政诉讼需在知道问题后6个月内提出（经复议的为15日），民事诉讼诉讼时效为3年，逾期将丧失救济权利。
  
• 证据固定：需保留协议原件、补偿标准依据文件（如征收公告、评估报告）、沟通记录等证据，避免证据灭失。
  
• 专业支持：补偿标准争议常涉及复杂法律适用（如地方性法规与上位法冲突）或专业评估，建议委托律师介入以精准主张权利。
  

如有具体协议文本或补偿标准依据文件，可进一步向我提供细节，我将协助分析补偿标准是否合法及维权策略。