药店骗保属于违法行为，需承担行政责任、刑事责任，同时可能面临民事赔偿，具体处理方式如下：

1. 行政责任
   根据《社会保险法》第八十七条，药店若通过虚构药品销售、伪造处方等方式骗取医保基金，社保行政部门将责令退回骗取金额，并处骗取金额2-5倍罚款；同时，医保部门可暂停其医保定点资格3-12个月，情节严重的直接取消定点资格。例如，某药店通过空刷医保卡套现，被查实后需退还全部违规所得，并缴纳相当于骗取金额3倍的罚款，同时被暂停医保结算服务6个月。

2. 刑事责任
   若骗保金额达到刑事立案标准（通常为6000元以上），药店直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能构成《刑法》第二百六十六条的诈骗罪。根据金额不同，量刑分为三档：

   • 数额较大（3000元-3万元）：处3年以下有期徒刑、拘役或管制；
     
   • 数额巨大（3万-50万元）：处3-10年有期徒刑；
     
   • 数额特别巨大（50万元以上）：处10年以上有期徒刑或无期徒刑。
     例如，某连锁药店通过系统篡改数据骗保200万元，负责人被判处10年有期徒刑，并处罚金50万元。

3. 民事赔偿
   医保部门或参保人有权依据《民法典》第一百二十二条要求药店返还骗取的医保基金，并赔偿因骗保行为导致的间接损失（如参保人因药店违规被暂停医保待遇期间的医疗费用自付部分）。

处理流程建议：

1. 内部自查：药店应立即停止可疑行为，核对医保结算记录与实际销售数据，主动向医保部门报告违规情况（可争取从轻处理）；
   
2. 配合调查：若已被立案调查，需完整提供药品进销存记录、处方单、监控录像等证据，避免销毁或篡改证据；
   
3. 整改措施：建立医保合规制度（如处方审核双签字、药品追溯系统），定期开展员工培训，防范再次违规。

特别提醒：若您发现药店存在骗保行为，可向当地医保局举报（部分地区有奖励机制），举报时需提供具体线索（如时间、金额、操作人员等）。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件处理细节。