针对职工故意违章造成公司损失的情况，公司可依法采取以下处理措施，我将从法律责任认定、公司内部处理、损失追偿途径三个维度展开说明：

1. 法律责任认定：职工需承担赔偿责任

根据《民法典》第1165条及《工资支付暂行规定》第16条，职工因故意或重大过失导致公司损失的，公司有权要求其赔偿直接经济损失。
关键点：

• 故意违章：职工明知行为违反规章制度或操作流程，仍主动实施（如偷工减料、违规操作设备），需承担全部或主要赔偿责任。
  
• 损失范围：仅限直接经济损失（如设备维修费、产品报废损失），不包括间接损失（如预期利润、商誉损害）。
  
• 举证责任：公司需证明职工存在故意行为、损失金额及因果关系（如监控录像、操作记录、损失清单等）。

2. 公司内部处理：依规处罚与解除合同

公司可通过内部规章制度对职工进行处罚，但需满足以下条件：

• 制度合法性：规章制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）、公示或告知职工（如培训签到、文件签字），且内容不违反法律强制性规定（如罚款不得超过月工资20%）。
  
• 处罚措施：
  
  • 警告、记过、降薪：适用于轻微故意违章（如未造成实际损失或损失较小）。
    
  • 解除劳动合同：若职工行为构成《劳动合同法》第39条“严重违反规章制度”或“严重失职造成重大损害”，公司可无偿解除合同，且无需支付经济补偿。
    示例：职工故意违规操作导致生产线瘫痪，直接损失超10万元，公司可依据制度解除合同并要求赔偿。

3. 损失追偿途径：协商、仲裁或诉讼

• 协商解决：公司可与职工协商赔偿金额及支付方式（如分期扣除工资，但每月扣除不得超过月工资20%）。
  
• 劳动仲裁：若协商不成，公司可向劳动仲裁委员会申请仲裁，要求职工赔偿损失。
  
• 法院诉讼：对仲裁结果不服或职工拒不履行，公司可向法院提起民事诉讼。
  注意：若职工行为涉嫌犯罪（如盗窃、故意毁坏财物），公司应立即报警，追究其刑事责任，同时提起刑事附带民事诉讼要求赔偿。

操作建议

1. 完善制度：确保规章制度明确“故意违章”的定义、处罚标准及赔偿流程，并留存制定、公示的证据。
   
2. 及时取证：事故发生后立即固定证据（如现场照片、操作记录、证人证言），避免职工否认或证据灭失。
   
3. 合法追偿：赔偿金额需合理，避免过度索赔导致职工生活困难（法院可能酌情调整）。
   

若您需要进一步分析具体案例或起草相关文件，可直接向我咨询，我会结合细节提供针对性方案。