结论：全资注册公司但仍以经营者个人名义交易的情况下，是否可以以个人名义起诉，需根据交易主体、合同签订情况以及法律关系的具体性质来判断。以下从不同角度进行分析：
一、交易主体与合同签订情况
若交易合同明确以个人名义签订：
- 在这种情况下，由于合同是个人与对方签订的，根据合同的相对性原则，个人作为合同的一方，有权依据合同条款以个人名义提起诉讼，要求对方履行合同义务或承担违约责任。
若交易合同以公司名义签订，但实际由个人操作：
- 如果合同上明确载明了公司作为交易主体，即使实际交易过程中由个人操作，从法律形式上看，公司仍是合同的一方。此时，若要以个人名义起诉，可能需要证明个人与公司之间存在某种代理关系或表见代理关系，且该关系被对方所认可或应被对方所知悉。然而，这通常较为复杂，且需要充分的证据支持。
- 另一种情况是，如果个人能够证明公司实际上是其“空壳”或“工具”，且交易的真实意图和利益归属均指向个人，那么在某些特定法律情境下（如揭开公司面纱原则），个人可能有机会以自身名义起诉。但这需要严格的法律条件和证据支持，且并非所有情况下都适用。
二、法律关系的具体性质
若交易涉及个人财产与公司财产的混同：
- 在全资注册公司的情况下，如果个人财产与公司财产未严格区分，导致交易过程中财产混同，那么个人可能因对公司债务承担连带责任而以个人名义被起诉或主动起诉。但这种情况更多涉及被告身份的问题，而非原告身份。不过，在特定情境下（如追讨公司应收款项时），如果个人能证明其与公司财产的混同状态及交易的真实意图，也可能有机会以个人名义起诉。
若交易涉及个人行为与公司行为的区分：
- 如果交易行为能够明确区分为个人行为与公司行为，且个人行为未违反公司章程或法律法规的禁止性规定，那么个人有权以其自身名义就其个人行为涉及的交易提起诉讼。
三、实际操作建议
审查交易合同：
- 首先，应仔细审查交易合同的签订主体、条款内容以及双方的权利义务关系，以确定合同的实际履行方和责任承担方。
收集证据：
- 收集与交易相关的所有证据，包括但不限于合同、发票、付款记录、通信记录等，以证明交易的真实情况和双方的权利义务关系。
咨询专业律师：
- 由于此类问题涉及复杂的法律关系和证据认定，建议在实际操作前咨询专业律师，以获取具体的法律建议和操作指导。
进一步思考：在实际操作中，全资注册公司但仍以经营者个人名义交易的情况可能涉及多种法律风险和税务问题。因此，建议企业在运营过程中严格区分个人财产与公司财产，规范交易行为，以避免不必要的法律纠纷和税务风险。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。