结论：小股东不同意其他股东提出的非同比增资方案时，股东会决议能否通过，主要取决于公司章程的规定以及股东会的表决程序是否符合法律要求。以下从不同角度进行详细分析：

1. 公司章程的约定：

   • 公司章程具有最高效力：在公司法领域，公司章程是公司的“宪法”，具有最高的法律效力。如果公司章程中明确规定了增资的决策程序、表决比例等，那么股东会应当遵循公司章程的规定进行决策。
   • 非同比增资的特别规定：若公司章程对非同比增资有特别规定，比如需要全体股东一致同意，或者对小股东有特别的保护条款，那么小股东的反对意见将直接影响股东会决议的通过。

2. 股东会的表决程序：

   • 一般表决程序：根据《公司法》的相关规定，股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。但这里并未明确规定增资必须同比进行，也未规定小股东的反对意见能直接阻止决议的通过。
   • 非同比增资的表决：对于非同比增资，如果公司章程没有特别规定，那么股东会可以按照一般表决程序进行决策。此时，即使小股东反对，只要代表三分之二以上表决权的股东同意，决议仍然可以通过。但这样的结果可能引发小股东的不满，甚至引发法律纠纷。

3. 小股东的保护措施：

   • 异议股东回购请求权：如果小股东认为非同比增资方案损害了其利益，且无法通过股东会决议阻止该方案的实施，小股东可以依据《公司法》的相关规定，请求公司以合理价格回购其股权。
   • 股东诉讼：在极端情况下，如果小股东认为非同比增资方案严重损害了其合法权益，且无法通过其他途径解决，小股东还可以向法院提起诉讼，要求撤销股东会决议或确认增资行为无效。

4. 实际操作建议：

   • 协商沟通：在提出非同比增资方案前，建议大股东与小股东进行充分的协商沟通，了解小股东的诉求和担忧，尽量达成共识。
   • 完善公司章程：为了避免未来可能出现的纠纷，公司可以在章程中明确规定增资的决策程序、表决比例以及非同比增资的特别规定等。
   • 寻求专业法律意见：在制定非同比增资方案或处理相关纠纷时，建议公司寻求专业律师的法律意见，确保决策的合法性和合规性。

总结与启示：小股东不同意其他股东提出的非同比增资方案时，股东会决议能否通过并非绝对，而是取决于公司章程的规定以及股东会的表决程序。因此，公司在制定增资方案时，应充分考虑小股东的利益和诉求，遵循公司章程和法律法规的规定，确保决策的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。