合作社并不直接适用《公司法》，而是适用《中华人民共和国农民专业合作社法》及其他相关法律法规。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律定位不同：

   • 合作社：合作社是一种特殊的经济组织形式，它主要由农民或其他经济组织成员自愿联合组成，以成员为主要服务对象，提供农业生产资料的购买、农产品的销售、加工、运输、贮藏以及与农业生产经营有关的技术、信息等服务。合作社的法律地位和运营规则主要由《中华人民共和国农民专业合作社法》来规范。
   • 公司：公司则是按照《公司法》设立的企业法人，具有独立的法人财产，享有法人财产权，以其全部财产对公司的债务承担责任。公司的设立、组织机构、股东权利与义务等均由《公司法》详细规定。

2. 组织结构与管理方式：

   • 合作社：合作社实行成员大会制度，成员大会是合作社的权力机构，按照一人一票的原则进行表决。合作社的管理层（如理事长、理事会等）由成员大会选举产生，对成员大会负责。
   • 公司：公司则设有股东会、董事会、监事会等组织机构，分别行使决策权、执行权和监督权。公司的管理层（如董事、经理等）由董事会聘任或解聘，对董事会负责。

3. 利润分配与责任承担：

   • 合作社：合作社的利润分配主要按照成员与合作社的交易量（额）比例返还，实行按交易量（额）返利为主的原则。合作社的成员以其账户内记载的出资额和公积金份额为限对合作社承担责任。
   • 公司：公司的利润分配则按照股东的出资比例或公司章程的规定进行。公司的股东以其认缴的出资额或认购的股份为限对公司承担责任。

4. 适用法律与监管：

   • 合作社：合作社的设立、变更、解散以及日常运营等均受《中华人民共和国农民专业合作社法》的规范，并接受农业行政主管部门等相关部门的监管。
   • 公司：公司则受《公司法》的规范，并接受工商行政管理部门等相关部门的监管。