反担保抵押权登记和普通抵押权登记确实存在区别，主要体现在以下几个方面：

1. 设立目的与法律关系：

   • 普通抵押权登记：通常是为了担保主债权的实现而设立，抵押权人与债务人之间存在直接的债权债务关系。抵押权登记后，抵押权人享有在债务人不履行到期债务时，就抵押物优先受偿的权利。
   • 反担保抵押权登记：则是在担保人（如保证人、抵押人等）为债务人向债权人提供担保后，为保障担保人追偿权的实现而设立的。反担保抵押权登记后，担保人在承担担保责任后，有权就反担保抵押物优先受偿。这里涉及三方主体：债务人、债权人和担保人，以及两层法律关系：债务人与债权人之间的主债权债务关系，以及担保人与债权人之间的担保关系，还有担保人与债务人之间的反担保关系。

2. 登记申请人与登记内容：

   • 普通抵押权登记：一般由抵押权人和抵押人共同申请，登记内容主要包括抵押权人、抵押人、被担保债权的种类和数额、债务人履行债务的期限、抵押财产的名称、数量等情况。
   • 反担保抵押权登记：虽然同样需要抵押权人（即原担保中的担保人）和抵押人（可能是债务人或其他提供反担保的第三人）共同申请，但登记内容会特别注明这是反担保抵押，并可能涉及原担保合同的相关信息，以明确反担保的指向和目的。

3. 法律效果与优先受偿权：

   • 普通抵押权登记：一旦完成，抵押权即设立，抵押权人享有在债务人不履行到期债务时，就抵押物优先受偿的权利。
   • 反担保抵押权登记：其法律效果在于保障担保人在承担担保责任后，能够就反担保抵押物优先受偿。这种优先受偿权是相对于债务人的其他债权人而言的，即担保人在承担担保责任后，有权在反担保抵押物的价值范围内优先于债务人的其他债权人受偿。

4. 适用场景与实务操作：

   • 普通抵押权登记：广泛应用于各种融资活动中，如银行贷款、企业债券发行等，是保障债权人债权实现的重要手段。
   • 反担保抵押权登记：则更多出现在担保人为债务人提供担保的场景中，如保证人为债务人向银行提供保证担保后，要求债务人提供反担保抵押以保障自己的追偿权。在实务操作中，反担保抵押权登记需要特别注意反担保合同的合法性和有效性，以及反担保抵押物的权属清晰和价值充足等问题。

建议：在实际操作中，无论是普通抵押权登记还是反担保抵押权登记，都应当严格遵守相关法律法规的规定，确保登记程序的合法性和有效性。同时，对于涉及复杂法律关系或高额价值的抵押物，建议咨询专业律师以获取更全面的法律意见和保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。