当您在试用期申请离职，但公司以损失公司利益为由不批准时，您可以依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定来妥善处理这个问题。以下是一些具体的应对步骤和法律依据，希望能帮助到您：
一、明确法律规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，即可解除劳动合同。这一规定具有法律效力，意味着只要您履行了提前三日的通知义务，就有权合法解除劳动合同，无需用人单位的批准。
二、采取合理措施
书面提交辞职信：
- 撰写一份正式的辞职信，明确表达您的辞职意愿，并注明预计离职日期（这个日期需要是您提交辞职信后的至少三日）。
- 通过电子邮件或纸质文件的形式，将辞职信提交给您的直接上级或人力资源部门，并确保有记录可查，比如邮件发送截图或签收单。
与上级或人力资源部门沟通：
- 在提交辞职信后，您可以与上级或HR进行面对面或电话沟通，解释您的辞职原因，并确认对方已经收到了您的辞职信。
- 如果对方表示不批准，您可以礼貌地重申法律规定，表明您已经履行了提前通知的义务。
保留证据：
- 保存好您提交辞职信的记录，以及与上级或HR的沟通记录，比如聊天记录、通话录音等。这些证据在后续可能出现的争议中会非常有用。
正常出勤至离职日：
- 在离职前，您应该继续按照公司的要求正常出勤，并完成工作交接，以避免给公司造成不必要的损失。
办理离职手续：
- 离职当日，您应该与公司结清工资、奖金、报销款项等，归还公司财物，并要求公司出具离职证明。
三、应对公司不配合的情况
如果公司拒绝办理离职手续或克扣您的工资，您可以采取以下措施：
与公司协商：
- 首先，您可以尝试通过友好协商的方式解决争议，表达您的合法权益和诉求。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉公司的违法行为。劳动监察部门会对此进行调查，并可能对公司进行处罚。
申请劳动仲裁：
- 如果投诉未能解决问题，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会会依法进行裁决，维护您的合法权益。
总之，您在试用期内有权提前三日通知公司解除劳动合同，无需公司的批准。如果公司不配合办理离职手续或克扣工资，您可以通过协商、投诉或申请仲裁等方式来维护自己的权益。希望这些建议能对您有所帮助。