分开三年是可以起诉离婚的，但关键在于证明夫妻感情确已破裂，且分居是因感情不和导致的。以下是我从多个角度为你详细分析：
法律角度
根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。其中，因感情不和分居满二年，且调解无效的，是法院应当准予离婚的法定情形之一。虽然你提到的是分居三年，但这同样满足“因感情不和分居满二年”的条件，甚至时间更长，更有可能被法院认定为感情破裂。
实际操作角度
收集证据：
- 在起诉离婚前，你需要收集充分的证据来证明你们因感情不和已经分居满三年。这些证据可以包括租房合同、水电费缴纳记录、分居协议、关于感情不和及分居的聊天记录、一方在外居住的租赁合同等。
- 证据的收集至关重要，它直接关系到法院是否会认定你们感情破裂并判决离婚。
提起诉讼：
- 准备好相关证据后，你可以向有管辖权的人民法院提起离婚诉讼。
- 法院在受理案件后，会安排调解。如果调解无效，且法院认定你们因感情不和分居满三年，感情确已破裂，那么法院会判决准予离婚。
注意事项
分居原因：
- 分居必须是因为夫妻双方感情不和导致的。如果分居是由于工作、学习等客观原因造成的，即使分居时间超过三年，也不符合法定离婚条件。
分居持续性：
- 分居应具有持续性，中间不应有间断。如果在分居期间有恢复共同居住生活的情况，可能会影响对“分居满三年”这一条件的认定。
调解程序：
- 法院在审理离婚案件时，会首先进行调解。只有在调解无效，且同时满足因感情不和分居满三年的条件下，法院才会判决准予离婚。
律师建议
- 在决定起诉离婚前，建议你充分准备相关证据，并仔细考虑离婚后的生活安排，包括财产分割、子女抚养等问题。
- 如果你对法律程序或证据收集有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。
总之，分开三年是可以起诉离婚的，但关键在于证明夫妻感情确已破裂且分居是因感情不和导致的。在准备起诉离婚时，请务必收集好相关证据并咨询专业律师的意见。