结论：员工仲裁企业后，后续应聘其他公司做背景调查时，不一定会被查出来，这主要取决于原企业是否愿意透露相关信息以及背景调查的具体内容和深度。

分析说明

1. 背景调查的内容与范围：

   • 背景调查通常包括教育背景、工作经历、职业资格、信用记录等方面的核实。对于劳动仲裁这一敏感信息，并非所有企业都会主动进行深入调查，除非该职位对诚信要求极高或涉及重要商业秘密。
   • 即使企业进行背景调查，也往往侧重于核实应聘者提供的信息的真实性，而非主动挖掘其过往的劳动纠纷记录。

2. 原企业的态度与行为：

   • 原企业可能出于保护商业秘密、避免法律纠纷或维护企业形象等考虑，不愿意透露员工仲裁企业的具体信息。
   • 即使原企业愿意透露，也需要遵守相关法律法规，如《劳动合同法》、《个人信息保护法》等，不得随意泄露员工个人信息或劳动纠纷细节。

3. 法律限制与保护：

   • 根据相关法律法规，员工的劳动仲裁记录属于个人隐私范畴，受到法律保护。未经员工同意，企业不得擅自公开或传播其劳动仲裁信息。
   • 如果企业在背景调查过程中非法获取或传播员工劳动仲裁信息，可能面临法律责任，包括但不限于赔偿损失、道歉等。

法律建议

1. 对于应聘者：

   • 在应聘时，可以主动了解并确认新企业背景调查的具体内容和范围，以便做好心理准备。
   • 如果担心劳动仲裁记录可能影响应聘结果，可以在面试过程中主动解释相关情况，展示自己的诚信和解决问题的能力。

2. 对于企业：

   • 在进行背景调查时，应遵守相关法律法规，尊重员工隐私权，不得非法获取或传播员工个人信息。
   • 如果确实需要了解员工过往的劳动纠纷情况，可以通过合法途径进行，如要求员工提供相关证明文件或进行书面确认。

可能的法律后果

• 如果企业非法获取或传播员工劳动仲裁信息，可能面临法律责任，包括但不限于被员工起诉要求赔偿损失、道歉等。
• 对于应聘者而言，如果因劳动仲裁记录被非法泄露而遭受损失，也可以依法维护自己的合法权益。

总结：员工仲裁企业后，在后续应聘其他公司做背景调查时，不一定会被查出来。这主要取决于原企业的态度、背景调查的具体内容和深度以及相关法律法规的限制。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。