在开庭时原告撤诉，法院通常会裁定准许撤诉，案件以原告撤诉的方式终结，但存在一些特殊情况及后续注意事项，具体如下：
- 一般情况下的处理
- 裁定准许撤诉：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十八条规定，宣判前，原告申请撤诉的，是否准许，由人民法院裁定。在开庭时原告提出撤诉申请，只要该撤诉申请不违反法律规定，不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益，法院一般会裁定准许原告撤诉。例如在一些民间借贷纠纷案件中，开庭时原告和被告私下达成和解，原告认为继续诉讼没有必要，向法院申请撤诉，法院经审查后会裁定准许。
- 诉讼费用处理：依据《诉讼费用交纳办法》第十五条，以调解方式结案或者当事人申请撤诉的，减半交纳案件受理费。所以原告撤诉后，法院会退还原告一半的案件受理费。比如原告起诉时缴纳了1000元案件受理费，撤诉后法院会退还500元。
- 特殊情况及处理
- 法院不准许撤诉的情况：如果原告撤诉可能会损害国家利益、社会公共利益或者他人合法权益，法院将不准许撤诉。例如在一些环境污染公益诉讼案件中，原告是环保组织，开庭时原告申请撤诉，但该案件涉及众多公众的环境权益，法院考虑到撤诉会对社会公共利益造成损害，就不会准许原告撤诉。
- 撤诉后再次起诉的限制：根据相关法律规定，原告撤诉或者人民法院按撤诉处理后，原告以同一诉讼请求再次起诉的，人民法院应予受理。但是，如果原告撤诉的离婚案件，没有新情况、新理由，原告在六个月内又起诉的，不予受理。比如原告第一次起诉离婚，开庭时撤诉，之后在六个月内没有新情况、新理由又再次起诉离婚，法院将不会受理。
- 撤诉后的后续事项
- 证据保存：即使原告撤诉，相关证据仍应妥善保存。因为撤诉后如果再次起诉，这些证据可能仍然会起到关键作用。例如在一些合同纠纷案件中，原告撤诉后发现被告又有新的违约行为，再次起诉时之前保存的合同、交易记录等证据就可能成为证明案件事实的重要依据。
- 关注被告行为：原告撤诉后要关注被告的行为，如果被告在撤诉后继续实施侵害原告权益的行为，原告可以收集相关证据，在必要时再次提起诉讼维护自己的合法权益。比如在人身损害赔偿纠纷中，原告撤诉后被告又对原告进行辱骂、威胁等，原告可以收集相关证据再次起诉要求被告承担相应的责任。