发现农村土地承包经营权证上的身份证号码错误后，应当及时申请更正，以避免后续可能产生的法律纠纷或权益受损。具体处理方式如下：

1. 联系发证机关：首先，需要联系颁发农村土地承包经营权证的当地农业农村主管部门（通常是乡镇政府或县级农业农村局），说明情况并咨询具体的更正流程。

2. 准备相关材料：根据发证机关的要求，准备必要的证明材料，通常包括：

   • 身份证原件及复印件（用于核对正确信息）；
   • 农村土地承包经营权证原件；
   • 村委会或集体经济组织出具的证明（证明身份证号码错误的事实）；
   • 其他可能需要的材料（如户口本、土地承包合同等）。

3. 提交更正申请：将准备好的材料提交给发证机关，并填写更正申请表。申请表中应明确说明错误的具体内容（如身份证号码错误）及正确的信息。

4. 等待审核与更正：发证机关会对提交的材料进行审核，确认无误后，会进行更正并重新颁发农村土地承包经营权证。整个过程可能需要一定的时间，请耐心等待。

5. 关注后续事宜：在更正完成后，务必核对新颁发的农村土地承包经营权证上的信息是否准确无误。同时，保留好相关的申请材料和更正证明，以备不时之需。

注意事项：

• 在处理过程中，保持与发证机关的沟通畅通，及时了解更正进度。
• 如果因身份证号码错误导致其他权益受损（如土地流转、补贴领取等），应及时向相关部门说明情况并申请更正或补救措施。
• 如果对更正流程或结果有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的合法权益。