两次流标后，根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，通常的处理方式如下：

1. 重新招标：

   • 法律依据：根据《招标投标法》第四十二条，依法必须进行招标的项目的所有投标被否决的，招标人应当依照本法重新招标。
   • 操作建议：在两次流标后，招标人应分析流标原因，如是否因招标文件设置不合理、投标人资格条件过高或过低、评标标准不明确等原因导致。针对这些问题进行修正后，重新发布招标公告，进行第三次招标。

2. 改变采购方式（需审批）：

   • 适用情形：若因项目特殊情况，如时间紧迫、技术复杂等，重新招标可能无法满足项目需求，招标人可以考虑改变采购方式。
   • 审批流程：改变采购方式需经过相关部门的审批。例如，对于政府采购项目，可能需要报经政府采购监督管理部门批准后，采用竞争性谈判、单一来源采购或询价等其他采购方式。
   • 操作建议：在申请改变采购方式时，招标人应详细说明流标原因、项目特殊情况及改变采购方式的必要性和合理性，以便获得审批部门的支持。

3. 分析流标原因并采取措施：

   • 原因分析：招标人应深入分析两次流标的原因，包括但不限于招标文件、投标人资格条件、评标标准、市场情况等方面。
   • 采取措施：根据分析结果，招标人可以采取相应措施，如调整招标文件、放宽或收紧投标人资格条件、明确评标标准、加强市场调研等，以提高招标的成功率和效果。

4. 考虑项目紧急性和重要性：

   • 项目紧急性：若项目时间紧迫，无法等待重新招标或改变采购方式的结果，招标人可以考虑与潜在投标人进行协商，寻求合作解决方案。
   • 项目重要性：对于特别重要的项目，招标人应更加谨慎地处理流标问题，确保选择到最合适的承包商或供应商，以保障项目的顺利实施和成功完成。