在我国现行法律体系下，散养户排污问题主要归生态环境主管部门管理，但根据具体情况，农业农村部门也可能参与管理。具体分析如下：
生态环境主管部门的主导管理
根据《中华人民共和国环境保护法》第十条及《畜禽规模养殖污染防治条例》第五条，生态环境主管部门（如生态环境局）是畜禽养殖污染防治的统一监管部门，负责制定排放标准、监督排污行为、查处环境违法行为等。即使散养户未达到规模化标准（如存栏量低于500头猪或50头牛），其排污行为仍需遵守《环境保护法》中关于水、大气、土壤污染防治的一般规定，由生态环境部门监管。
农业农村部门的协同管理
农业农村部门（如农业农村局）依据《畜牧法》及《动物防疫法》，对畜禽养殖的防疫、粪污资源化利用等技术指导和服务负有职责。若散养户的排污问题涉及粪污处理技术不规范（如未进行堆肥发酵直接排放），农业农村部门可联合生态环境部门进行指导或整改。
属地政府的联动责任
根据《环境保护法》第六条，地方各级人民政府对本行政区域的环境质量负责。若散养户排污导致农村环境脏乱差，乡镇政府或街道办事处可能需协调生态环境、农业农村等部门共同处理，例如组织清理或督促整改。
建议：散养户应主动了解当地对畜禽养殖排污的具体要求（如是否需建设化粪池、粪污处理设施等），避免因违规排污面临罚款或停业整顿。若遇到管理职责不清的情况，可向当地生态环境部门或农业农村部门咨询，或直接向我提问，我会结合具体地区政策进一步分析。