在单位拒执案件中，若涉及多个判决，处理方式需根据判决之间的关系、执行阶段及具体案情综合判断，具体如下：

1. 若多个判决为同一法院或不同法院就同一法律关系作出，且内容不冲突

   • 执行合并处理：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第464条，若多个判决基于同一事实或法律关系，且被执行人相同，法院可依职权或申请将执行案件合并处理，统一分配执行财产。
     
   • 执行顺序协调：若判决内容涉及不同给付义务（如金钱债务与行为义务），法院通常优先执行对被执行人财产影响较小的判决（如行为义务），再执行金钱债务，以保障债权人公平受偿。

2. 若多个判决内容存在冲突或涉及不同法律关系

   • 执行异议程序：被执行人或利害关系人可依据《民事诉讼法》第232条提出执行异议，主张某一判决存在错误或与另一判决冲突，法院将审查后裁定中止或继续执行。
     
   • 再审或第三人撤销之诉：若发现判决存在错误（如虚假诉讼），可通过再审程序撤销错误判决，或由未参与诉讼的案外人提起第三人撤销之诉（需在知道权益受损后6个月内提出）。

3. 若单位拒不执行多个判决，可能构成拒不执行判决、裁定罪

   • 刑事追责条件：根据《刑法》第313条，单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员需满足“有能力执行而拒不执行，情节严重”的要件（如隐藏财产、暴力抗拒执行等），方可追究刑事责任。
     
   • 多判决的叠加影响：若单位拒不执行多个判决，且每个判决均达到“情节严重”标准，可能被认定为“情节特别严重”，从而加重刑罚（如处3年以上7年以下有期徒刑）。

4. 实务建议

   • 债权人角度：及时申请强制执行，并提交所有生效判决作为执行依据；若发现被执行人转移财产，可申请法院采取查封、扣押、冻结等措施，并追究其拒执罪责任。
     
   • 被执行单位角度：主动履行判决义务，避免刑事风险；若对判决有异议，应通过合法程序（如申请再审、执行异议）解决，而非消极对抗执行。

总结：单位拒执案件中，多个判决的处理需结合判决关系、执行程序及刑事追责规则综合施策。建议根据具体案情，及时咨询专业律师以制定针对性策略。