面对对方公司不按合作协议执行的情况，您可以采取以下措施来维护自身权益：

1. 审查合作协议：

   • 首先，仔细审查双方签订的合作协议，确认对方未履行或未完全履行的具体条款内容。
   • 明确协议中关于违约责任、争议解决方式等关键条款，为后续行动提供依据。

2. 与对方沟通协商：

   • 在确认对方违约后，尝试与对方进行友好沟通，了解其未履行协议的原因，并寻求解决方案。
   • 沟通时，保持冷静和理性，明确表达己方的诉求和期望，争取通过协商达成一致，避免矛盾升级。

3. 发送律师函或正式通知：

   • 如果沟通无果，您可以考虑委托律师向对方发送律师函或正式通知，明确指出其违约行为，并要求其在规定期限内履行协议或承担违约责任。
   • 律师函或正式通知具有法律效应，能够给对方施加一定的压力，促使其重视并解决问题。

4. 考虑诉讼或仲裁：

   • 如果对方仍然拒绝履行协议或承担违约责任，您可以根据合作协议中的争议解决方式（如诉讼或仲裁），向有管辖权的人民法院提起诉讼或向约定的仲裁机构申请仲裁。
   • 在诉讼或仲裁过程中，您需要提供充分的证据证明对方的违约行为以及己方因此遭受的损失，以便法院或仲裁机构作出公正的裁决。

5. 采取保全措施：

   • 在诉讼或仲裁过程中，为了防止对方转移财产或逃避责任，您可以考虑向法院申请财产保全或证据保全措施。
   • 财产保全能够冻结对方的银行账户、查封其财产等，确保判决或裁决能够得到有效执行；证据保全则能够固定关键证据，防止其灭失或被篡改。

6. 关注后续执行：

   • 如果法院或仲裁机构作出有利于您的裁决或判决，您需要关注后续的执行情况。
   • 如果对方仍然拒绝履行裁决或判决，您可以向法院申请强制执行，通过法律手段迫使对方履行义务。

在采取上述措施时，您需要注意以下几点：

• 保留证据：在整个过程中，务必保留好与对方沟通的记录、合作协议、付款凭证等关键证据，以便在需要时提供证明。
• 及时行动：一旦发现对方违约，应尽快采取行动，避免错过最佳的维权时机。
• 寻求专业帮助：如果您对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分维护。

最后，我想强调的是，每个案件都有其独特性和复杂性，因此在处理此类纠纷时，建议您根据具体情况制定合适的策略，并随时向我咨询以获取更具体的法律建议。