在农村农田上建祖堂是否违法，需根据具体情况来判断。若建设行为符合相关法律法规和规定，并经过了合法的审批程序，则不违法；反之，若未遵循法律规定和审批流程，则可能构成违法。以下是对此问题的详细分析：
一、合法建设祖堂的情况
符合规划要求：
- 建设地点需与村庄的总体规划和土地利用规划相一致。祖堂作为村庄的公共设施或文化场所，其建设选址应避开基本农田保护区、生态保护红线区域等禁止建设区域，且满足建筑密度、高度、间距等规划指标。
获得必要审批：
- 用地审批：应取得合法的土地使用手续。对于集体建设用地，需经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或代表同意，并报乡（镇）人民政府审核，最终由县级人民政府批准。若占用的是农田，则还需考虑是否符合土地用途变更的相关规定。
- 建设工程规划许可：需向城乡规划主管部门或相关建设管理部门申请建设工程规划许可证，提交建筑设计方案、用地证明等材料，经审核符合规划要求后方可建设。
遵守其他法规：
- 在建设过程中，必须严格遵守国家和地方关于建筑质量、安全、环保等方面的法律法规和标准规范，确保建筑材料质量合格，施工安全措施到位，避免对周边环境造成污染。
二、违法建设祖堂的情况
未批先建：
- 若未取得任何审批手续就擅自开工建设祖堂，如未经土地管理部门批准占用集体土地建设，或未获得建设工程规划许可证就进行施工，均违反了《中华人民共和国城乡规划法》和《中华人民共和国土地管理法》等相关法律规定。
违反规划：
- 建设地点不符合村庄规划和土地利用规划，如在基本农田保护区、生态保护红线区域等禁止建设区域内建设祖堂，或超出规划许可的用地范围、建筑高度、建筑面积等指标进行建设，均属违法行为。
改变土地用途：
- 农田是用于农业生产的土地，若在未经批准的情况下改变土地用途，如将农田擅自改为建设祖堂用地，也违反了土地管理法规。
破坏环境和资源：
- 建设过程中若造成生态环境破坏、水土流失等问题，或违反文物保护等相关规定，如破坏具有历史文化价值的古建筑、古遗址等，同样构成违法。
三、建议与结论
为避免不必要的法律纠纷和处罚，村民在决定建设祖堂前，应充分了解并遵守当地的相关法律法规和规划要求。建议咨询当地的自然资源、城乡规划、建设等相关部门，确保建设行为合法合规。若对具体法律条款或审批流程有疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律解释和建议。
综上所述，农村农田上建祖堂是否违法取决于是否符合法律法规和经过合法的审批程序。只有依法依规进行建设，才能确保祖堂建设的合法性和可持续性。