劳动仲裁时公司注销了，劳动者仍可通过多种途径来维护自己的合法权益。以下是对此问题的全面分析和建议：
一、明确公司注销的时机与影响
劳动仲裁前公司已注销：
- 劳动者可将公司权利义务的承继者或有关责任人（如股东、出资人）列为被申请人，向仲裁机构请求裁决。此时，关键在于确定公司注销后的责任主体，并收集相关证据证明其与原公司的关联及应承担的责任。
仲裁过程中公司注销：
- 劳动者可变更或增加被申请人，将公司的股东、实际控制人或负有清偿责任的第三人等列为新的被申请人，请求他们履行生效的仲裁裁决。这要求劳动者及时关注公司动态，并在发现注销情况后迅速采取行动。
劳动仲裁后公司注销：
- 首先需确定公司注销是否合法合规，特别是清算程序是否依法进行，并通知了作为债权人的劳动者。若清算程序存在瑕疵，如未通知劳动者参与清算，劳动者可向清算组成员主张权利，要求其承担赔偿责任。
二、根据清算情况采取不同措施
公司已依法进行清算：
- 若清算程序合法，且劳动争议的相关债权债务已得到妥善处理，劳动者可能难以通过劳动仲裁获得额外赔偿。但若清算过程中存在遗漏或错误处理劳动者权益的情况，劳动者仍可寻求法律救济。
公司未经依法清算即注销：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第二十条，有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任。劳动者可要求这些主体承担支付责任，并收集相关证据（如公司注销文件、股东承诺承担债务的证据等）以支持其主张。
三、法律程序的衔接与执行
申请追加被执行人：
- 劳动者在发现公司注销后，应及时向法院申请追加相关主体为被执行人，通过执行程序实现权益。这要求劳动者提供充分的证据证明新被执行人与原公司的关联及应承担的责任。
寻求行政救济：
- 劳动者可向工商行政管理部门反映公司违法注销的情况。工商部门有权对违法注销行为进行调查和处理，并可能责令恢复公司登记或采取其他行政措施。
四、实际操作建议
收集证据：
- 劳动者应首先收集与公司注销相关的所有证据材料，包括公司注销文件、清算报告、股东信息、债权债务处理情况等。这些证据将对于后续的法律程序至关重要。
及时行动：
- 发现公司注销后，劳动者应迅速采取行动，向仲裁机构或法院提出变更或追加被申请人的申请，并提交相关证据材料。延迟行动可能导致证据丧失或法律程序受阻。
持续沟通：
- 在整个维权过程中，劳动者应保持与仲裁机构、法院以及工商行政管理部门的沟通，确保自己的诉求得到妥善处理。同时，及时关注法律程序的进展和结果，以便采取进一步的行动。
举例说明：假设劳动者小张在劳动仲裁过程中发现公司注销了。他首先收集了公司注销的相关文件、清算报告以及股东信息等证据。然后，他向仲裁机构提出了变更被申请人的申请，并将公司的股东列为新的被申请人。仲裁机构在受理申请并核实后，继续审理了案件，并根据双方证据和庭审情况作出了裁决。最终，小张通过法律程序成功维护了自己的合法权益。
法律依据：
- 《劳动保障监察条例》第九条：任何组织或者个人对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为，有权向劳动保障行政部门举报。劳动者认为用人单位侵犯其劳动保障合法权益的，有权向劳动保障行政部门投诉。
- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第二十条：公司解散应当在依法清算完毕后，申请办理注销登记。公司未经清算即办理注销登记，导致公司无法进行清算，债权人主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任的，人民法院应依法予以支持。
综上所述，劳动仲裁时公司注销了并不意味着劳动者的权益无法得到保障。劳动者应根据具体情况采取不同的措施来维护自己的合法权益，并在必要时寻求我的专业法律帮助。