最有效的追回物流公司协议押金的方式需根据具体情况选择，常见有效途径包括协商解决、向监管部门投诉、提起民事诉讼或申请仲裁。以下是具体分析：

1. 协商解决
   首先尝试与物流公司友好沟通，明确要求退还押金。协商时需注意：

   • 保留书面沟通记录（如微信、邮件、短信），避免口头约定；
     
   • 引用合同条款（如有）或法律依据（如《民法典》第587条关于定金返还的规定），增强说服力；
     
   • 若对方拖延，可设定合理期限并明确逾期后果（如将采取法律手段）。

2. 向监管部门投诉
   若协商无果，可向物流公司所在地的市场监督管理部门或交通运输主管部门投诉。投诉时需准备：

   • 押金支付凭证（转账记录、收据等）；
     
   • 双方签订的协议或合同；
     
   • 沟通记录及对方拒绝退还的证据。
     监管部门介入后，物流公司可能因行政压力主动退还押金。

3. 提起民事诉讼
   若押金金额较大或对方态度强硬，可直接向法院起诉。诉讼要点包括：

   • 案由选择：以“合同纠纷”或“不当得利纠纷”为案由；
     
   • 证据准备：除上述材料外，还需证明押金性质（如是否为“定金”或“履约保证金”）；
     
   • 诉讼请求：要求退还押金并支付利息（如合同有约定）或赔偿损失。
     注：若合同中约定了仲裁条款，则需申请仲裁而非诉讼。

4. 申请仲裁（如适用）
   若协议中明确约定仲裁条款（如“发生争议提交XX仲裁委员会仲裁”），则需按约定申请仲裁。仲裁流程与诉讼类似，但一裁终局，效率较高。

行动建议：

1. 优先通过协商+投诉组合方式解决，成本低且周期短；
   
2. 若涉及金额较大（如超过1万元）或对方明显恶意，建议直接起诉；
   
3. 操作过程中务必保留所有证据原件，避免证据灭失。
   

如有具体协议文本或沟通记录，可进一步分析押金性质及追回概率。