关于您同居二十年期间签订的财产、车、工资分配协议，在两人分离后是否还有效的问题，这主要取决于协议的具体内容、签订时的法律状态以及双方后续的行为。以下是我从不同角度为您进行的分析：

1. 协议的有效性基础：

   • 如果双方在签订协议时均具备完全民事行为能力，协议内容是双方真实意思的表示，且没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有违背公序良俗，那么该协议在签订时就是有效的。
   • 有效的协议对双方均具有法律约束力，除非存在法定或约定的解除、变更情形，否则协议内容应持续有效。

2. 分离对协议效力的影响：

   • 分离本身并不直接导致协议失效。协议的效力主要取决于其签订时的合法性和双方后续的行为。
   • 如果双方在分离后仍然按照协议内容履行各自的义务，那么协议显然继续有效。
   • 如果一方或双方在分离后不再履行协议，或者对协议内容产生争议，这并不意味着协议自动失效，而是需要通过法律途径来解决争议，如协商、调解、诉讼等。

3. 可能影响协议效力的因素：

   • 协议内容是否合法：如果协议内容存在违法之处，如侵犯他人权益、违反法律强制性规定等，那么该部分内容可能无效。
   • 双方行为是否一致：如果一方或双方在分离后的行为与协议内容不符，且这种不符行为持续存在，可能构成对协议的违约或变更。但违约或变更并不直接导致协议整体失效，而是可能引发法律责任或需要重新协商协议内容。
   • 是否存在法定或约定的解除情形：如果协议中约定了特定的解除条件或情形，且这些条件或情形在分离后发生，那么协议可能因此失效。此外，如果法律也规定了某些情形下协议可以解除，且这些情形在分离后出现，同样可能导致协议失效。

4. 建议：

   • 如果您对协议的效力存在疑问，或者双方在分离后对协议内容产生争议，我建议您首先回顾协议的具体内容，查看是否存在上述可能影响协议效力的因素。
   • 如果争议无法通过协商解决，您可以考虑寻求法律援助或提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。在此过程中，您需要提供充分的证据来证明自己的主张，如协议文本、双方的行为记录等。

总结来说，同居二十年期间签订的财产、车、工资分配协议，在两人分离后并不自动失效。其效力主要取决于协议签订时的合法性、双方后续的行为以及是否存在法定或约定的解除情形。如果您对协议的效力或双方的行为存在疑问，欢迎随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。