当您发现业主土地证上面的土地面积计算不合法，即土地证上的面积与实际测量面积存在不符时，您可以按照以下步骤来处理这一问题，以确保您的合法权益得到妥善维护：

一、明确差异并初步核实

首先，您需要仔细比对土地证上记载的面积与您通过专业测量得到的实际面积，确认两者之间的具体差异。接着，您应仔细核查原始的土地证文件、相关测量数据以及登记记录，以排除误解或数据录入错误的可能性。这一步骤对于初步判断问题的性质至关重要。

二、核实测量的准确性

1. 确认测量机构与方法：确保进行测量的是具有合法资质的专业机构，且所采用的测量方法科学、规范，符合国家标准和行业要求。这是保证测量结果准确性的前提。

2. 考虑重新测量：如果您对初次测量结果存疑，可以委托另一家具备资质的测量机构进行重新测量。通过对比不同机构的结果，您可以更准确地判断土地的实际面积。

三、深入分析面积不符的原因

1. 登记错误：可能是由于工作人员在录入数据时出错，或土地界址认定有误导致的。您需要查阅相关档案，核实登记过程中的各个环节，以确定是否存在登记错误。

2. 土地变化：自然因素（如水土流失）或人为因素（如私自填挖）都可能导致土地面积发生变化。您需要结合实际情况，分析面积变化的具体原因，并考虑这些变化是否合法。

四、根据不同情况采取相应措施

1. 面积误差较小且不影响权益：如果误差在可接受范围内，且不影响土地的正常使用和您的权益，您可以考虑维持现状。但为了未来避免纠纷，建议您向当地土地管理部门咨询备案事宜。

2. 面积误差较大且为登记错误：

   • 申请更正登记：您需要准备相关材料，如原土地证、新测量报告、身份证等，向不动产登记机构提出更正申请。
   • 填写申请表并等待审核：在申请表中详细说明更正原因，并附上证明材料。等待审核通过后，办理更正手续。

3. 面积误差较大且为土地变化导致：

   • 办理变更登记：如果面积变化是由于合法土地使用变更导致的，您需要提交审批文件、测量报告等材料，办理土地变更登记。
   • 处理违规行为：如果面积变化是由于私自改变土地现状导致的，您需要先整改违规行为，再根据实际情况办理变更手续。

五、解决纠纷

在处理过程中，如果涉及相邻土地使用者的权益或存在边界争议，您应优先尝试与对方协商解决。如果协商无果，您可以向土地管理部门或人民政府申请行政处理，或者依法向人民法院提起诉讼，通过司法程序维护自身合法权益。

六、总结与建议

在整个处理过程中，您务必遵守当地法律法规和程序，保持耐心和理性，与相关部门和专业人士积极沟通合作。同时，我也建议您定期核对土地证信息与实际状况，及时发现并处理问题，以避免潜在的法律风险和经济损失。希望这些建议能对您有所帮助。