核心结论：在高速被查到携带六条烟，是否违法及如何处理，需分情况讨论，具体如下：

1. 若为自用且无贩卖意图
   根据《中华人民共和国烟草专卖法》第二十二条规定，个人在跨地（市）携带卷烟的最高限量为每人次1万支（即50条）。若您携带的六条烟（共3000支）未超过该限额，且能证明是自用（如无大量相同品牌、无销售痕迹等），一般不构成违法，执法部门通常会予以放行或口头警告。但需注意：

   • 部分地区可能对自用烟草的携带量有更严格的地方性规定，需以当地烟草专卖局解释为准；
     
   • 若无法证明自用（如携带多种品牌、包装完整未拆封等），可能被怀疑为贩卖行为，需进一步接受调查。

2. 若存在贩卖意图或超过限额
   若您携带的六条烟超过个人自用范围，或被认定为用于贩卖（如无烟草专卖零售许可证、携带大量相同品牌、有销售记录等），则可能涉嫌违反《烟草专卖法》第三十五条：

   • 无准运证运输烟草专卖品：若未办理烟草专卖品准运证，可能被没收违法运输的烟草专卖品和违法所得，并处以罚款（罚款金额为违法运输烟草专卖品价值的20%-50%）；
     
   • 非法经营罪：若情节严重（如多次运输、金额较大），可能构成非法经营罪，面临刑事处罚（根据《刑法》第二百二十五条，可处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处违法所得一倍以上五倍以下罚金）。

3. 处理建议

   • 配合调查：如实说明携带目的，提供相关证明（如自用可出示购买凭证、行程记录等）；
     
   • 申请复议或诉讼：若认为处罚不当，可在收到处罚决定书后60日内申请行政复议，或6个月内直接向法院提起行政诉讼；
     
   • 咨询专业意见：若涉及金额较大或情节复杂，建议直接向我咨询，我会根据具体证据（如运输记录、交易凭证等）为您分析法律风险及应对策略。

温馨提示：烟草属于国家专卖品，运输、销售均需严格遵守法律规定。若您有跨地区携带烟草的需求，建议提前了解当地限额规定，并保留好自用证明，避免不必要的法律风险。