结论：你朋友让你写借条并用你的卡给公司转账这一行为存在较大的法律风险，不建议这么做。下面从不同角度为你详细分析。

从借条的法律性质和风险角度

1. 借条的法律意义：借条是表明债权债务关系的书面凭证，一般由债务人书写并签章，表明债务人已经欠下债权人借条注明金额的债务。当你写下借条，从法律层面就意味着你成为了这笔债务的债务人，有义务按照借条约定偿还借款。
2. 实际借款人与名义借款人不符的风险：在这个情况中，实际借款人是你的朋友或者朋友所在合作项目相关方，但借条却由你出具。如果后续朋友或相关方不承认这笔债务，或者出现还款纠纷，债权人会依据借条直接向你主张权利。你可能会陷入无端的债务纠纷中，需要承担还款责任，即便你实际并未使用这笔借款。例如，假设朋友与公司的合作出现问题，公司无法收回预期收益，公司可能就会拿着你出具的借条要求你还款。

从转账行为的法律性质和风险角度

1. 转账记录的证明力：用你的卡给公司转账，转账记录会显示资金从你的账户流出到公司账户。在法律上，这可能会被认定为是你与该公司之间存在资金往来关系。如果后续出现纠纷，这笔转账记录可能成为证明你与公司有经济关系的重要证据，而难以清晰界定这是你代朋友转账的行为。
2. 可能被认定为实际借款人：结合你出具的借条和转账记录，从证据链的角度看，很容易让第三方认为你是实际的借款人。一旦公司认为你是借款人并向你追讨债务，你需要花费大量的时间和精力去证明自己只是代朋友转账，这会增加你的举证难度和诉讼成本。

从朋友合作项目的风险角度

1. 合作项目失败的风险：朋友与其他公司签订合作协议，合作项目可能存在失败的风险。如果项目失败，公司可能会面临损失，在这种情况下，公司可能会试图从各种途径挽回损失，而你出具的借条和转账记录可能会成为公司向你主张权利的依据。
2. 朋友信用风险：如果朋友在合作过程中出现不诚信的行为，比如挪用资金、虚假合作等，导致公司遭受损失，公司可能会将矛头指向你，因为你提供了借条和转账记录，从形式上看与这笔资金有直接关系。

法律建议

1. 拒绝朋友的要求：明确向朋友表示这种操作方式存在很大的法律风险，你无法承担这样的风险，拒绝出具借条和用你的卡转账。
2. 建议朋友采取合法合规方式：如果朋友确实需要资金用于合作项目，建议朋友以自己的名义与相关方签订借款协议，并通过自己的账户进行资金往来，这样可以明确各方的权利义务关系，避免产生不必要的纠纷。
3. 保留相关证据：如果你已经参与了部分相关事宜，比如朋友与你沟通此事的过程等，要注意保留相关的聊天记录、通话录音等证据，以防后续出现纠纷时能够证明自己的清白。

如果你后续还有其他关于债务债权、合同纠纷等方面的法律问题，都可以直接向我咨询。