企业违规套取国家财政专项资金，将面临行政处罚、刑事追责以及信用惩戒等多方面的法律后果，具体处理方式需根据违规情节的严重程度来确定。以下从不同角度详细分析：

一、行政处罚层面

1. 责令改正与资金追回：

   • 财政部门或相关主管部门在发现企业违规套取国家财政专项资金后，会首先责令企业限期改正，并要求企业将违规套取的资金全额退回。

2. 罚款与没收违法所得：

   • 根据违规情节的严重程度，财政部门或相关主管部门可能会对企业处以罚款，罚款金额通常与违规套取的资金金额相关。
   • 如果企业因违规套取资金而获得了违法所得，这些违法所得也将被没收。

3. 暂停或取消财政补助资格：

   • 对于严重违规的企业，财政部门或相关主管部门可能会暂停或取消其未来一段时间内申请财政补助的资格，以示惩戒。

二、刑事追责层面

1. 诈骗罪：

   • 如果企业以非法占有为目的，通过虚构事实、隐瞒真相等手段骗取国家财政专项资金，且数额较大，那么企业及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能构成诈骗罪，将面临刑事追责。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。

2. 其他相关罪名：

   • 根据违规套取资金的具体手段和情节，企业及其相关人员还可能构成贪污罪、挪用公款罪等其他罪名，同样将面临刑事追责。

三、信用惩戒与行业禁入

1. 信用惩戒：

   • 违规套取国家财政专项资金的企业将被纳入失信名单，其信用记录将受到严重影响。
   • 这将导致企业在未来申请贷款、参与招投标、享受税收优惠等方面受到限制或禁止。

2. 行业禁入：

   • 对于严重违规的企业，相关主管部门可能会采取行业禁入措施，禁止其在一定期限内或永久性地参与特定行业的经营活动。

四、建议与措施

1. 立即停止违规行为：

   • 企业一旦发现自身存在违规套取国家财政专项资金的行为，应立即停止该行为，并主动向财政部门或相关主管部门报告。

2. 积极配合调查与整改：

   • 企业应积极配合财政部门或相关主管部门的调查工作，如实提供相关资料和情况说明。
   • 同时，企业应制定并实施整改措施，确保类似问题不再发生。

3. 寻求法律帮助：

   • 如果企业对违规行为的性质、后果及处理方式存在疑问或争议，可以寻求专业律师的法律帮助，以维护自身的合法权益。