事业单位未建立往来账款台账，主要违反了财务管理及内部控制的相关规定，具体分析如下：
违反财务管理制度
根据《中华人民共和国会计法》及《政府会计制度——行政事业单位会计科目和报表》等规定，事业单位需建立健全财务管理制度，确保会计资料真实、完整。往来账款台账是记录单位与外部单位或个人之间债权债务关系的重要会计资料，未建立台账可能导致账目不清、资金流向不明，违反会计资料完整性的要求。此外，若因未建立台账导致财务信息失真，还可能违反《中华人民共和国预算法》中关于预算执行真实性的规定。
违反内部控制规范
依据《行政事业单位内部控制规范（试行）》，单位应加强经济活动的财务控制和监督，防范财务风险。往来账款管理是内部控制的重要环节，未建立台账可能导致资金管理失控、资产流失或舞弊风险增加。例如，长期未清理的往来款项可能掩盖单位实际财务状况，甚至引发贪污、挪用公款等违法犯罪行为。
可能涉及审计与监督责任
根据《中华人民共和国审计法》，审计机关对事业单位的财务收支进行审计监督。若未建立往来账款台账，审计时可能被认定为财务管理不规范，单位及相关责任人可能面临整改要求或行政处分。此外，若因台账缺失导致国有资产损失，还可能涉及《财政违法行为处罚处分条例》中的追责条款。
建议：事业单位应立即完善往来账款台账制度，明确记录债权债务的发生、变更及清理情况，并定期与会计账簿核对，确保账实相符。若已因未建立台账引发问题，建议尽快委托专业机构进行财务梳理，降低法律风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作或合规建议。