姐姐和妹妹当然可以一起注册公司，这是完全合法的行为。从法律角度来看，亲属关系并不影响自然人共同设立公司的权利。以下是具体分析：

1. 法律资格层面
   根据《公司法》及相关规定，只要姐姐和妹妹均具备完全民事行为能力（年满18周岁且精神健康），即可作为自然人股东共同设立公司。法律未对股东之间的亲属关系作出限制性规定，因此姐妹共同注册公司在主体资格上不存在障碍。

2. 公司类型选择
   姐妹可共同设立有限责任公司或股份有限公司，具体需根据出资规模、经营需求等因素选择：

   • 有限责任公司：适合中小规模经营，股东以其出资额为限承担有限责任，设立程序相对简便。
     
   • 股份有限公司：适合大规模融资需求，但设立条件更严格（如最低注册资本、发起人数量等）。
     若姐妹仅作为投资者，也可选择合伙企业形式，但需注意合伙企业中普通合伙人需承担无限连带责任。

3. 股权结构设计建议
   为避免未来可能因家庭关系变化引发的股权纠纷，建议：

   • 明确出资比例：在公司章程中清晰约定姐妹各自的出资额、持股比例及分红规则，避免口头约定。
     
   • 约定决策机制：对重大事项（如增资、解散、对外担保等）的表决权比例作出书面约定，防止因意见分歧影响公司运营。
     
   • 预留股权调整空间：可设置股权动态调整机制（如根据经营贡献重新分配股权），以适应公司发展需求。

4. 家庭财产与公司财产隔离
   需特别注意：

   • 避免财产混同：姐妹作为股东的个人财产应与公司财产严格区分，否则可能面临“刺破公司面纱”风险，导致股东对公司债务承担连带责任。
     
   • 规范财务制度：建立完整的财务账簿，保留原始凭证，确保公司财务独立透明。

5. 税务合规要点
   姐妹共同经营公司需关注：

   • 个人所得税：股东从公司取得分红时需按“利息、股息、红利所得”缴纳20%个人所得税。
     
   • 增值税/企业所得税：根据公司经营范围，需依法申报缴纳增值税或企业所得税。
     
   • 印花税：公司设立时需按注册资本的0.05%缴纳印花税。

温馨提示：若姐妹涉及特殊身份（如一方为公务员、军人等），需提前确认是否受《公务员法》等限制性规定约束。如有具体操作疑问，可进一步向我说明公司类型、出资计划等细节，我将为您提供更精准的合规建议。