结论前置：员工入职办理工卡收费一般是不合法的，但具体还需根据实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 从法律法规角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条的规定，用人单位招用劳动者，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。工卡作为员工入职后用于身份识别和考勤等用途的卡片，其办理费用理应由用人单位承担，而不应转嫁给员工。
   • 如果用人单位以办理工卡为名向员工收取费用，这可能构成违法收取财物的行为，员工有权拒绝并可以向劳动监察部门投诉。

2. 从实际操作角度：

   • 在实际操作中，有些用人单位可能会以各种名义（如工本费、制作费等）向员工收取工卡费用。然而，这些费用通常都是不合理的，因为工卡的制作成本应该已经包含在用人单位的运营成本中。
   • 如果员工遇到此类情况，可以首先与用人单位进行沟通，明确指出相关法律法规的规定，要求用人单位承担工卡费用。如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，寻求帮助。

3. 从特殊情况角度：

   • 虽然一般情况下员工入职办理工卡收费是不合法的，但也存在一些特殊情况。例如，如果工卡具有特殊功能（如门禁、消费等），且这些功能需要员工个人承担部分费用（如消费账户的充值等），那么这种情况下收取费用可能是合理的。但即便如此，用人单位也应该在入职前明确告知员工相关费用情况，并征得员工的同意。

法律建议：

• 如果员工遇到用人单位要求支付工卡费用的情况，建议首先与用人单位进行友好沟通，明确表达自己的立场和依据的法律法规。
• 如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，并提供相关证据（如收费通知、聊天记录等）以支持自己的主张。
• 在整个过程中，员工应保留好相关证据，以便在需要时维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果用人单位被查实存在违法收取工卡费用的行为，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括责令退还违法收取的费用、罚款等。
• 同时，这种行为也可能影响用人单位的声誉和员工关系，对用人单位的长期发展产生不利影响。

总之，员工入职办理工卡收费一般是不合法的，员工有权拒绝并可以向劳动监察部门投诉。如果遇到此类情况，建议员工保持冷静、理性处理，并寻求法律帮助以维护自己的合法权益。