客运站不按时发车，运管部门会根据具体情况，依据相关法律法规进行处罚，主要包括警告、罚款等措施。具体分析如下：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十九条的规定，客运经营者若存在不按批准的客运站点停靠或者不按规定的线路、公布的班次行驶等行为，县级以上道路运输管理机构有权责令其改正，并处以1000元以上3000元以下的罚款；若情节严重，原许可机关甚至可以吊销其相应的道路运输经营许可证件。虽然该条款直接针对的是客运经营者，但客运站作为提供客运服务的重要环节，若其不按时发车导致客运经营者无法按公布的班次行驶，客运站也可能因未履行其管理或服务职责而受到相应处罚，具体处罚依据可能涉及地方性法规或行业管理规定。
   • 此外，如果客运站的不按时发车行为违反了与乘客之间的运输合同，还可能涉及《中华人民共和国民法典》中关于合同违约的相关规定，乘客有权要求客运站承担违约责任，如赔偿损失等。但这一层面的责任更多属于民事范畴，与运管部门的行政处罚不同。

2. 处罚措施：

   • 警告：对于初次违规或情节较轻的客运站，运管部门可能会先给予警告，要求其立即改正不按时发车的行为，并加强内部管理，确保类似情况不再发生。
   • 罚款：若客运站不按时发车的行为较为严重或屡教不改，运管部门将依据相关法律法规对其处以罚款。罚款的金额将根据违规情节的严重程度、造成的后果以及客运站的整改态度等因素综合确定。
   • 其他措施：在极端情况下，如果客运站的不按时发车行为严重扰乱了市场秩序或损害了乘客的合法权益，运管部门还可能采取更严厉的措施，如责令停业整顿、吊销相关经营许可证件等。

3. 实际操作中的考量：

   • 在实际操作中，运管部门在决定处罚措施时，会充分考虑客运站的违规情节、造成的后果以及客运站的整改态度等因素。对于能够积极配合调查、主动承认错误并采取有效措施进行整改的客运站，运管部门可能会酌情减轻处罚；而对于拒不整改或整改不力的客运站，则可能会加重处罚。

建议：作为客运站，应严格遵守相关法律法规和行业规范，确保按时发车，为乘客提供安全、便捷、舒适的运输服务。若遇到特殊情况导致无法按时发车，应及时向乘客说明情况并采取相应的补救措施，以减少对乘客的影响并避免可能的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。