结论：移动合约到期后仅通过短信通知就扣费是否合法，需根据具体情况判断，包括合约条款、用户是否明确同意续约、运营商是否尽到充分告知义务等因素。以下从不同角度详细分析：

一、合约条款的约定

1. 合约明确约定自动续约：

   • 如果移动合约中明确约定了“合约到期后自动续约，除非用户提前通知取消”，且运营商在合约到期前通过合理方式（如短信、邮件等）提醒了用户续约事宜，那么合约到期后运营商继续扣费可能是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第四百六十五条，依法成立的合同，受法律保护。依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。因此，如果合约中有明确约定，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该约定是有效的。

2. 合约未明确约定自动续约：

   • 如果合约中没有明确约定自动续约，或者约定了需要用户明确同意才能续约，那么运营商在合约到期后仅通过短信通知就扣费可能是不合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国消费者权益保护法》第八条，消费者享有知悉其购买、使用的商品或者接受的服务的真实情况的权利。如果运营商未经用户明确同意就擅自扣费，可能侵犯了用户的知情权。

二、用户是否明确同意续约

• 即使合约中有自动续约的条款，但如果用户明确表示不同意续约，或者运营商未能提供用户同意续约的充分证据，那么运营商继续扣费也是不合法的。
• 实践建议：用户可以在合约到期前主动联系运营商，明确表达是否同意续约的意愿。如果不同意续约，应要求运营商停止扣费，并保留好相关证据（如通话记录、短信记录等）。

三、运营商是否尽到充分告知义务

• 运营商在合约到期前有义务通过合理方式提醒用户续约事宜，并告知用户续约的相关条款和费用。如果运营商未能尽到充分告知义务，导致用户对续约事宜不知情或误解，那么运营商继续扣费可能也是不合法的。
• 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百条，当事人在订立合同过程中有下列情形之一，造成对方损失的，应当承担赔偿责任：（一）假借订立合同，恶意进行磋商；（二）故意隐瞒与订立合同有关的重要事实或者提供虚假情况；（三）有其他违背诚信原则的行为。如果运营商未尽到充分告知义务，可能构成违背诚信原则的行为。

四、用户应对措施

1. 与运营商协商：

   • 用户可以先尝试与运营商协商解决，要求运营商停止扣费并退还已扣费用。

2. 向消费者协会投诉：

   • 如果协商无果，用户可以向当地的消费者协会投诉，寻求帮助和支持。

3. 寻求法律途径：

   • 如果问题仍然无法解决，用户可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁。

总结与建议：移动合约到期后仅通过短信通知就扣费是否合法，需根据合约条款、用户是否明确同意续约、运营商是否尽到充分告知义务等因素综合判断。如果您遇到了类似问题，建议先仔细审查合约条款，并与运营商沟通协商。如果无法解决，可以寻求消费者协会或法律途径的帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。