结论：商家有营业执照但没有公章，并不直接构成违法，关键在于公章的缺失是否违反了相关法律法规对于公司或个体工商户印章管理的具体要求，以及是否影响了商家的正常经营和法律行为的效力。以下从不同角度进行分析：
合法情况分析
公章非强制要求所有场合：
- 并非所有商业活动或法律文件都需要加盖公章。例如，一些简单的合同或协议，双方签字即可生效，无需加盖公章。因此，如果商家在没有公章的情况下，仍然能够正常进行经营活动，且不影响其法律行为的效力，那么这种缺失并不构成违法。
个体工商户的特殊情况：
- 对于个体工商户而言，其经营规模相对较小，法律对其印章管理的要求也相对宽松。在某些情况下，个体工商户可能并不需要刻制公章，而是使用个人名章或签字来代替。因此，如果商家是个体工商户，且其经营活动符合相关法律法规的要求，那么没有公章并不构成违法。
公章遗失或损坏的临时情况：
- 如果商家原本有公章，但因遗失、损坏等原因暂时无法使用，且已及时向相关部门报备并正在办理补刻手续，那么在这种情况下，商家的经营活动仍然可以视为合法。
违法情况分析
违反印章管理规定：
- 根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》等相关法律法规，公司或个体工商户在设立时，通常需要刻制公章等印章，并报公安机关备案。如果商家在设立时未按规定刻制并备案公章，或者在使用过程中违反了印章管理的相关规定（如私刻公章、滥用公章等），那么这种行为就构成违法。
影响法律行为效力：
- 在某些情况下，公章是法律行为生效的必要条件。例如，公司之间的合同、协议等文件，通常需要加盖公司公章才能生效。如果商家在没有公章的情况下，仍然试图进行需要加盖公章的法律行为，那么这种行为可能因缺乏法律效力而构成违法或无效。
法律建议
及时补刻并备案公章：
- 如果商家确实需要公章来进行经营活动或法律行为，那么建议及时补刻并备案公章，以确保其经营活动的合法性和有效性。
了解并遵守印章管理规定：
- 商家应了解并遵守相关法律法规对于印章管理的具体要求，避免私刻、滥用公章等违法行为的发生。
咨询专业律师：
- 如果商家对于公章的使用和管理存在疑问或困惑，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。不过，作为许彬律师，我随时准备为你提供公司事务、股权转让领域的法律咨询，你可以直接向我提问。
总结：商家有营业执照但没有公章并不直接构成违法，但需要注意公章的缺失是否违反了相关法律法规对于印章管理的具体要求，以及是否影响了商家的正常经营和法律行为的效力。如果商家确实需要公章来进行经营活动或法律行为，建议及时补刻并备案公章，并了解并遵守相关法律法规对于印章管理的具体要求。