结论概述：针对您提出的“实际参与经营的法人要发工资，但投资款发完就没了怎么办”的问题，这主要涉及到公司资金管理和法人薪酬支付两个层面。以下是从不同角度给出的分析和建议。
一、公司资金管理层面
审查公司财务状况：
- 首先，需要详细审查公司的财务状况，包括但不限于资产负债表、现金流量表等，以明确公司目前的资金状况和偿债能力。
- 如果公司确实面临资金短缺，应考虑通过增加注册资本、寻求外部融资（如银行贷款、股权融资等）或优化运营成本等方式来缓解资金压力。
制定合理的资金使用计划：
- 根据公司的经营计划和财务状况，制定合理的资金使用计划，确保公司运营所需的资金得到合理分配。
- 在资金紧张的情况下，应优先保障公司核心业务的运营和员工薪酬的支付，避免因为资金问题导致公司运营受阻或员工流失。
二、法人薪酬支付层面
明确法人身份与薪酬关系：
- 法人作为公司的代表，其薪酬支付应遵循公司章程和相关法律法规的规定。
- 如果法人同时担任公司的高级管理人员或员工，其薪酬应按照公司内部的薪酬制度和劳动合同来执行。
考虑薪酬支付方式：
- 在公司资金紧张的情况下，可以考虑与法人协商调整薪酬支付方式，如延期支付、分期支付或以股权、期权等形式替代部分现金薪酬。
- 但需注意，任何薪酬调整都应遵循法律法规和公司章程的规定，并确保法人的合法权益不受损害。
法律风险防范：
- 在处理法人薪酬支付问题时，应确保不违反相关法律法规，如《劳动法》、《公司法》等，以避免引发法律纠纷。
- 如果公司确实无法按时支付法人薪酬，应及时与法人沟通并说明情况，寻求法人的理解和支持，并共同寻找解决方案。
三、具体操作建议
召开股东会或董事会：
- 针对公司资金紧张和法人薪酬支付问题，可以召开股东会或董事会进行讨论和决策。
- 在会议上，可以提出增加注册资本、寻求外部融资、优化运营成本或调整薪酬支付方式等方案，并征求股东或董事的意见和建议。
咨询专业财务或法律人士：
- 如果公司对资金管理和法人薪酬支付问题感到困惑或无法自行解决，可以咨询专业的财务或法律人士。
- 他们可以提供专业的建议和指导，帮助公司制定合理的资金使用计划和薪酬支付方案，并防范潜在的法律风险。
四、可能面临的法律后果
- 如果公司违反相关法律法规或公司章程的规定，未按时支付法人薪酬，可能会面临法律纠纷和行政处罚等后果。
- 因此，公司在处理法人薪酬支付问题时，应确保遵循法律法规和公司章程的规定，并保障法人的合法权益不受损害。
总结与建议：针对您提出的问题，建议公司首先审查财务状况并制定合理的资金使用计划；同时明确法人身份与薪酬关系，并考虑调整薪酬支付方式以缓解资金压力；在处理过程中应确保遵循相关法律法规和公司章程的规定，并咨询专业财务或法律人士的意见和建议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。