工厂因工作失误对员工进行罚款，其合法性并非一概而论，而是需要根据具体情况来详细分析。以下是对这一问题的全面解答：
一、工厂无权直接罚款的普遍情况
根据《中华人民共和国劳动法》和《工资支付暂行规定》的相关规定，用人单位，包括工厂，不得随意克扣劳动者的工资。罚款，作为一种对劳动者经济上的惩罚措施，本质上属于克扣工资的范畴。因此，在法律未明确授权企业罚款权的情况下，工厂直接对员工进行罚款通常是不合法的。罚款更多地属于行政处罚或刑事处罚的范畴，而工厂作为民事主体，并不具备实施此类处罚的主体资格。
二、工厂可合法扣除工资的特定情形
尽管工厂不能直接罚款，但在某些特定情形下，工厂可以依法扣除员工的部分工资。这些情形主要包括：
代扣代缴义务：工厂可以依法代扣员工的个人所得税、社保费用等法定项目。这些扣款具有明确的法律依据，并且受到严格监管。
劳动者过错赔偿责任：如果员工因个人原因给工厂造成了经济损失，工厂有权按照劳动合同的约定要求员工进行赔偿。根据《工资支付暂行规定》的相关规定，赔偿款可以从员工的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地的月最低工资标准。
违反规章制度的处理：如果工厂拥有完善且合法的规章制度，并且这些规章制度经过了民主程序制定并公示，其中明确规定了何种错误行为会导致扣款以及扣款的具体标准和程序，那么工厂在员工违反这些规章制度时，可以依据规章制度进行扣款。但需要注意的是，这种扣款不能以“罚款”的名义进行，而应视为对员工违反规章制度的一种经济性处理措施，且扣款金额需符合法定限制。
三、工厂违法罚款的法律后果
如果工厂违规对员工进行罚款，可能会面临以下法律责任：
行政责任：劳动行政部门有权责令工厂改正其违法行为，并可能处以罚款。
民事责任：员工有权要求工厂返还被扣的款项，并可能要求工厂赔偿因此造成的损失。
刑事责任：在情节严重的情况下，工厂的相关责任人员可能构成拒不支付劳动报酬罪，面临刑事处罚。
四、员工权益保护建议
如果员工认为工厂的扣款行为不合法，首先应尝试与工厂进行协商解决。如果协商不成，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
综上所述，工厂因工作失误对员工进行罚款的合法性取决于多种因素，包括是否有明确且合法的规章制度、扣款行为是否符合规章制度且经过民主程序制定并公示、扣款金额是否超过法定限制等。员工应了解自己的权益，并在必要时采取适当措施来维护自己的合法权益。