结论：新公司注册时，企业法人股东的电子签章并非只能由法人签署，具体取决于公司章程或股东会决议的约定。

详细分析：

1. 电子签章的法律效力：

   • 电子签章，作为数字化时代的产物，其法律效力在《中华人民共和国电子签名法》中得到了明确确认。该法规定，可靠的电子签名与手写签名或盖章具有同等的法律效力。因此，在企业法人股东进行新公司注册时，使用电子签章是合法且有效的。

2. 企业法人股东电子签章的签署主体：

   • 企业法人股东的电子签章，理论上可以由具有代表权的主体进行签署。这通常包括公司的法定代表人（即法人），但也可能包括根据公司章程或股东会决议授权的其他人员。
   • 法定代表人签署：作为公司的法律代表，法定代表人有权代表公司签署各类法律文件，包括新公司注册时的相关文件。因此，使用法定代表人的电子签章是常见且合法的方式。
   • 授权代表签署：如果公司章程或股东会决议明确授权了其他人员（如公司高管、特定股东等）代表公司签署文件，那么这些人员也可以使用其电子签章进行签署。这种情况下，需要确保授权的合法性和有效性，以及签署过程的合规性。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 公司章程和股东会决议：在新公司注册前，应仔细审查公司章程和股东会决议，明确哪些人员有权代表公司签署文件，以及签署的具体范围和程序。
   • 电子签章的管理和使用：企业应建立完善的电子签章管理制度，确保电子签章的安全性和可控性。同时，在使用电子签章时，应遵循相关法律法规和操作流程，确保签署的合法性和有效性。
   • 法律风险防范：为了避免潜在的法律风险，企业在进行新公司注册时，应咨询专业律师的意见，确保所有签署行为都符合法律法规的要求。

建议：

• 在进行新公司注册时，企业法人股东应首先审查公司章程和股东会决议，明确签署主体和签署程序。
• 如果需要由非法定代表人签署文件，应确保获得合法的授权，并保留相关授权文件作为证据。
• 在使用电子签章时，应遵循相关法律法规和操作流程，确保签署的合法性和有效性。
• 如有任何疑问或不确定之处，建议及时咨询专业律师以获取法律意见和帮助。

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