您好，关于在职员工如何申请工伤认定的问题，以下是我为您整理的详细解答：
一、申请主体与申请时限
申请主体：
- 职工所在用人单位是承担首要工伤申报义务的主体。
- 若用人单位未在规定时限内提出申请，工伤职工或者其近亲属、工会组织也有权在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内提出工伤认定申请。
申请时限：
- 用人单位应在事故伤害发生之日或者职业病被确诊后的30日内提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，可适当延长申请时限。
- 工伤职工或者其近亲属、工会组织的申请时限为事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内。
二、申请材料
根据申请主体的不同，所需提交的材料也有所差异：
单位提出工伤认定申请：
- 工伤认定申请表1份；
- 劳动、聘用合同文本复印件或者与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）、人事关系的证明材料1份；
- 医疗机构出具的医疗诊断证明原件（含职工受伤害时的初诊诊断证明）或者依法承担职业病诊断的医疗、卫生机构出具的职业病诊断证明书（职业病诊断鉴定书）原件1份；
- 受伤害职工本人身份证正反面复印件1份；
- 事故调查报告1份（包含事故经过、原因分析、整改措施及处理意见，需参与调查人员签名并加盖单位公章）；
- 现场勘验笔录1份；
- 证人证言2份（2名证人，每个证人1份，需提供证人的身份证复印件）。
职工本人或者近亲属提出工伤认定申请：
- 工伤认定申请表1份；
- 劳动、聘用合同文本复印件或者与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）、人事关系的证明材料1份；
- 医疗机构出具的医疗诊断证明原件（含职工受伤害时的初诊诊断证明）或者依法承担职业病诊断的医疗、卫生机构出具的职业病诊断证明书（职业病诊断鉴定书）原件1份；
- 受伤害职工本人身份证正反面复印件1份；
- 证人证言2份（2名证人，每个证人1份，需提供证人的身份证复印件）；
- 如有委托代理人，需提交授权委托书、委托代理人身份证明；受伤害职工近亲属提出申请的，需提交有效的近亲属关系证明；工会组织提出申请的，需提交工会介绍信和办理人身份证明。
特殊情形下的额外材料：
- 若职工死亡，需提交医疗机构或者公安机关出具的死亡证明；
- 若在工作时间和工作场所内因履行工作职责受到暴力等意外伤害，需提交公安部门的证明、人民法院生效裁判文书或者其他有效证明；
- 其他特殊情况，需提交能够证明情况的材料。
三、申请流程
- 准备材料：确保所有材料真实、完整，所写内容准确无误。伪造申请材料涉嫌骗取工伤保险基金的，将依法追究相关法律责任。
- 提交申请：将准备好的材料提交至当地的社会保险行政部门或者指定的窗口。窗口工作人员会审核材料，并当场打印《工伤认定申请材料（证据）接收清单》，登记申请资料数量及申请时间，双方签字确认无误后各保留一份。
- 材料补正：若审核材料不全，窗口会出具《工伤认定申请补正材料通知书》，一次性告知申请人需要补正的全部材料及补正时限。申请人应当按补正通知书要求在规定时限内完成申请材料补正。
- 受理决定：审核材料齐全的，社会保险行政部门会在15日内作出受理或者不予受理决定。
四、认定后续流程
社会保险行政部门受理工伤认定申请后，会开展工伤调查程序，并在自受理之日起60日内做出工伤认定决定，出具《认定工伤决定书》或《不予认定工伤决定书》。自工伤认定决定作出之日起20日内，会将决定书送达用人单位和受伤害职工或者其近亲属。
希望以上解答能够帮助您更好地了解在职员工如何申请工伤认定的流程。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。