结论：在商标侵权案中，从犯违法所得6000元，是否会被判刑需结合具体案情判断，但存在被追究刑事责任的可能性。以下从不同角度进行分析：
一、法律责任的基本框架
根据《中华人民共和国刑法》第二百一十三条至第二百一十五条的规定，商标侵权行为可能构成假冒注册商标罪、销售假冒注册商标的商品罪或非法制造、销售非法制造的注册商标标识罪。对于从犯，其法律责任通常根据其在共同犯罪中的作用和地位来认定，一般会从轻、减轻处罚或者免除处罚，但这并不意味着从犯一定不会被判刑。
二、违法所得与量刑的关系
违法所得作为量刑情节：
- 违法所得是衡量犯罪情节轻重的一个重要因素。在商标侵权案件中，违法所得数额的大小往往会影响量刑的轻重。然而，违法所得并非决定是否判刑的唯一因素，还需考虑其他犯罪情节，如犯罪手段、犯罪次数、犯罪后果等。
具体数额与量刑标准：
- 虽然6000元的违法所得数额不算巨大，但根据相关司法解释和实践，即使数额不大，如果犯罪情节严重，如多次侵权、造成恶劣影响等，仍有可能被追究刑事责任。
- 此外，不同地区的司法实践可能存在差异，对相同数额的违法所得可能作出不同的量刑判断。
三、从犯的特殊考量
从犯的认定：
- 在共同犯罪中，从犯是指起次要或者辅助作用的人。对于从犯的认定，需要综合考虑其在犯罪中的地位、作用、参与程度等因素。
从犯的量刑原则：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二十七条的规定，对于从犯，应当从轻、减轻处罚或者免除处罚。这意味着，在相同犯罪情节下，从犯的量刑通常会比主犯轻。
- 然而，这并不意味着从犯一定不会被判刑。如果从犯的犯罪情节严重，即使其地位次要或辅助，仍有可能被追究刑事责任。
四、实际案例与司法实践
- 在司法实践中，存在许多从犯因违法所得数额不大但犯罪情节严重而被判刑的案例。这些案例表明，违法所得数额并非决定是否判刑的唯一因素，还需综合考虑其他犯罪情节。
- 同时，也存在一些从犯因犯罪情节轻微、认罪态度好等因素而被免除处罚或适用缓刑的案例。
五、建议与行动
及时咨询专业律师：
- 鉴于商标侵权案件的复杂性和专业性，建议您及时咨询专业律师，以便更准确地了解案件的法律性质和可能面临的法律责任。
积极配合调查与诉讼：
- 如果您或您的亲友涉及此类案件，应积极配合相关部门的调查和诉讼工作，如实陈述事实、提供证据，以便争取从轻或减轻处罚的机会。
关注案件进展与结果：
- 在案件处理过程中，应密切关注案件的进展和结果，及时与律师沟通，了解案件的法律状态和可能面临的法律后果。
最后，商标侵权案中从犯违法所得6000元是否会被判刑，需结合具体案情判断。如果您或您的亲友涉及此类案件，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。