针对您提出的农村有人恶意堵公用排水沟并占用部分基本农田，且拒绝村委会和镇司法所调解的问题，我给出以下分析和建议：

1. 法律定性：

   • 恶意堵塞公用排水沟：此行为可能构成对相邻权的侵害。根据《民法典》中关于相邻关系的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。恶意堵塞排水沟，影响他人正常排水，是侵犯相邻权的行为，受损方有权要求停止侵害、排除妨碍。
   • 占用基本农田：此行为违反了《土地管理法》中关于基本农田保护的规定。基本农田是受到严格保护的耕地，任何单位和个人不得擅自占用或改变其用途。占用基本农田可能面临行政处罚，甚至刑事责任。

2. 解决途径：

   • 再次调解：尽管村委会和镇司法所的调解未能成功，但调解作为一种非诉讼解决方式，仍然值得尝试。可以邀请更多有威望的第三方参与调解，或者寻求上级政府部门的协助，以增加调解的成功率。
   • 行政投诉：向当地国土资源管理部门或农业农村部门投诉占用基本农田的行为。这些部门有权对违法行为进行调查，并依法作出处理决定。
   • 民事诉讼：如果调解和行政投诉均无法解决问题，受损方可以考虑向人民法院提起民事诉讼。对于堵塞排水沟的行为，可以提起相邻权纠纷之诉；对于占用基本农田的行为，如果造成了损失，也可以提起侵权责任之诉。
   • 刑事报案：如果占用基本农田的行为情节严重，构成犯罪（如非法占用农用地罪），受损方或相关部门可以向公安机关报案，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。

3. 注意事项：

   • 收集证据：在采取任何行动之前，务必收集充分的证据来支持自己的主张。这包括现场照片、视频、证人证言、相关部门的调查报告等。
   • 保持冷静：在处理此类纠纷时，保持冷静和理性至关重要。避免采取过激行为，以免加剧矛盾或引发新的法律问题。
   • 寻求专业帮助：由于法律程序复杂且专业性强，建议受损方在必要时寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助受损方更好地维护自己的合法权益。

针对您的情况，我建议首先尝试再次调解或向相关部门投诉。如果这些方式无法解决问题，再考虑通过民事诉讼或刑事报案来维护自己的权益。 在整个过程中，务必保持冷静、理性，并收集充分的证据来支持自己的主张。如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问。