结论概述：结合新闻背景，湛海高铁过海通道工程团队选择的“两步走”方案，若符合相关法律法规规定的程序要求，包括项目立项、可行性研究、环境影响评价、规划许可、施工许可等环节，并获得了相应的批准文件，则该方案是符合相关程序规定的。以下从多个维度进行详细分析：
一、程序合规性的基本要求
在建设工程领域，任何大型项目的实施都必须遵循严格的程序规定，以确保项目的合法性、安全性和可持续性。对于湛海高铁过海通道这样的国家级工程，其程序合规性尤为重要。这通常包括但不限于以下几个关键环节：
- 项目立项：项目需经过国家或地方相关部门的立项审批，明确项目的建设目标、规模、投资等基本情况。
- 可行性研究：进行详尽的可行性研究，包括技术可行性、经济可行性、环境可行性等方面，以评估项目的可行性和风险。
- 环境影响评价：根据《环境影响评价法》等相关法律法规，对项目可能对环境产生的影响进行评估，并提出相应的预防措施。
- 规划许可：获得城市规划部门或相关主管部门的规划许可，确保项目符合城市规划和土地利用规划。
- 施工许可：在完成上述所有前期工作后，向建设主管部门申请施工许可，获得施工许可后方可正式开工。
二、“两步走”方案的程序合规性分析
根据新闻背景，湛海高铁过海通道工程团队选择了“两步走”的方案，即近期采用轮渡方式过渡，远期预留海底隧道接口。这一方案的选择，从程序合规性的角度来看，需要关注以下几个方面：
- 前期工作的充分性：工程团队是否进行了充分的可行性研究和环境影响评价，以确保“两步走”方案在技术、经济和环境上都是可行的。
- 规划许可的兼容性：该方案是否与城市规划和土地利用规划相兼容，是否获得了相关规划部门的许可。
- 施工许可的阶段性：由于“两步走”方案涉及两个阶段的建设，工程团队是否分别获得了两个阶段的施工许可，或者是否在总体施工许可中明确了分阶段实施的内容。
- 公众参与和透明度：在项目决策过程中，是否充分听取了公众意见，确保了决策的透明度和公正性。
三、可能涉及的法律责任和风险
如果“两步走”方案在程序上存在不合规的情况，工程团队可能面临以下法律责任和风险：
- 行政责任：可能因违反相关法律法规而受到行政处罚，如罚款、责令停工等。
- 民事责任：如果因程序不合规导致项目对第三方造成损害，工程团队可能需要承担相应的民事赔偿责任。
- 刑事责任：在极端情况下，如果程序不合规行为构成犯罪，相关责任人员可能面临刑事追究。
四、建议与启示
- 加强前期工作：工程团队应进一步加强前期工作，确保可行性研究、环境影响评价等工作的充分性和准确性。
- 严格遵守程序规定：在项目实施过程中，应严格遵守相关法律法规规定的程序要求，确保项目的合法性和合规性。
- 增强公众参与和透明度：在项目决策过程中，应充分听取公众意见，增强决策的透明度和公正性，以赢得公众的支持和信任。
综上所述，湛海高铁过海通道工程团队选择的“两步走”方案，在程序上是否合规，取决于其是否遵循了相关法律法规规定的程序要求，并获得了相应的批准文件。如果程序合规，则该方案是合法且可行的。如有任何法律疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。