在行政诉讼中，若案件超过了法定的诉讼时效，处理方式及可能后果需依据相关法律规定来详细阐述。以下是对这一问题的清晰、详细且有深度的解答：
一、超过诉讼时效的一般处理原则
法院审查与驳回：
- 法院在受理行政诉讼案件时，会严格审查诉讼时效。若原告的起诉超过了法定的诉讼时效期间，并且不存在法定的正当理由，法院将依据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，裁定驳回原告的起诉。
原告丧失胜诉权：
- 即使原告的起诉被法院受理，但由于超过了诉讼时效，原告在实体审理过程中将丧失通过法律强制手段获得法院支持其诉求的权利。这意味着，即便原告的诉讼请求在实体上可能合理合法，但仅因超时效，法院也不会判决原告胜诉。
被告的时效抗辩权：
- 被告（通常为行政机关）在诉讼中有权提出诉讼时效抗辩。一旦被告提出并经法院确认，法院将作出不利于原告的裁决。值得注意的是，被告需主动提出抗辩，法院一般不会主动适用诉讼时效规定进行审查和裁判。
二、特殊情况下的处理
不可抗力或其他正当理由：
- 根据《行政诉讼法》的相关规定，若公民、法人或其他组织因不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他不属于其自身的原因耽误了起诉期限，被耽误的时间不计算在起诉期限内。原告需提供充分证据证明存在这些特殊情况，并经法院审查认可后，方可继续进行诉讼程序。
- 例如，因人身自由受到限制而无法提起诉讼的情形，被限制人身自由的时间同样不计算在起诉期间内。
其他救济途径：
- 尽管超过了行政诉讼时效，原告仍可以尝试通过行政复议、信访、调解等非诉讼方式寻求救济。这些方式虽不具有行政诉讼的强制力，但在某些情况下仍能有效解决问题，为原告提供一定的法律保障。
三、建议与总结
及时咨询专业律师：
- 面对行政诉讼时效问题，当事人应尽早咨询专业律师或法律机构，以获取具体、专业的建议。律师可以根据当事人的具体情况，分析是否存在时效中止、中断或延长的可能性，并指导当事人采取合适的行动。
积极探索补救措施：
- 若错过诉讼时效，当事人应积极探索是否存在特殊情况可申请延长时效，或考虑通过其他途径（如行政复议、信访等）解决问题。同时，当事人也可以与行政机关进行协商，寻求和解或调解的可能性。
重视法律时效问题：
- 对于任何法律纠纷，当事人都应重视法律时效问题，及时采取行动并咨询专业人士意见。避免因错过时效而丧失胜诉权或面临其他不利的法律后果。
综上所述，行政诉讼超过诉讼时效将面临严格的法律后果，但并非完全没有补救措施。当事人应充分了解相关法律规定，并在专业指导下采取合适的行动以维护自身权益。