员工病假期间，公司是否扣工资需根据具体情况判断，但通常公司应依法支付病假工资或疾病救济费，且支付标准不得低于当地最低工资标准的80%。以下是对此问题的详细分析：

一、法定医疗期内的工资支付

1. 医疗期定义：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息，而用人单位不得因此解除劳动合同的时限。医疗期的长短根据员工的实际工作年限和在本单位的工作年限来确定，一般为3个月到24个月不等。

2. 工资支付标准：

   • 在医疗期内，公司应按照相关规定支付病假工资或疾病救济费。这些费用可以低于员工正常出勤时的工资，但不得低于当地最低工资标准的80%。例如，若当地月最低工资标准为2000元，则病假工资最低不得低于1600元。
   • 具体的病假工资计算基数通常根据劳动合同约定的工资标准确定；若劳动合同无约定，则按集体合同执行；两者均无时，按员工正常出勤月工资的70%确定。同时，病假工资的计算系数还依据员工的连续工龄确定，如连续工龄不满两年的，病假工资为本人工资的60%；满两年不满四年的，为70%；以此类推，直至连续工龄满八年及以上的，为100%。

二、超过法定医疗期的处理

• 若员工超过法定医疗期仍不能从事原工作或用人单位另行安排的工作，用人单位可解除劳动合同，但需提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付一个月工资，并支付经济补偿。在此情况下，若员工未提供劳动，用人单位无需按病假工资标准支付工资。但在解除劳动关系手续办理完毕前，双方劳动关系仍然存续，用人单位应按当地规定处理相关待遇。

三、未履行请假手续的情况

• 如果员工生病但未按照公司规定的流程履行请假手续，公司可能会按照旷工处理。旷工期间，公司通常不支付工资。若旷工情况严重违反公司规章制度，公司还有权解除劳动合同。

四、公司规定与劳动合同的影响

• 除了法律规定外，公司规定和劳动合同中的相关条款也会影响病假期间的工资支付。因此，在处理此类问题时，还需仔细审查公司规定和劳动合同的具体内容。例如，部分用人单位可能规定员工在一定期限或范围内请病假不扣工资，如带薪病假制度；或者通过集体协商达成特别约定，如特定疾病全额发放病假工资。

五、员工权益保护与建议

• 了解权益：员工在病假前应详细了解公司的规章制度、劳动合同以及当地的劳动法律法规，确保自己清楚在病假期间的权益和义务。
• 履行手续：生病时，员工应按照公司规定的流程及时履行请假手续，提交病假证明等必要材料，以避免被视为旷工。
• 协商与投诉：如果公司违反法律规定，在员工病假期间不支付工资或支付的工资低于当地规定的标准，员工有权与公司进行协商，要求公司按照法律规定支付病假工资。协商不成时，可以向劳动监察部门投诉或直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

总结来说，员工病假期间公司是否扣工资并非一概而论，而是需综合考虑法律规定、公司规章制度及劳动合同的具体内容。员工应了解自己的权益和义务，并采取适当措施保护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。