非法没收协议书主要违反了《中华人民共和国民法典》中关于物权保护、合同效力以及侵权责任的相关规定。以下从不同角度进行详细分析：
物权保护角度：
- 根据《民法典》的相关规定，物权是权利人依法对特定的物享有直接支配和排他的权利。非法没收协议书若涉及对他人财物的无权占有或处置，直接侵犯了物权人的合法权益。例如，若协议书未经物权人同意，擅自将其财物没收或处置，这明显违反了物权保护的原则。
合同效力角度：
- 合同是双方意思表示一致的产物，必须遵循合法、公平、诚实信用的原则。非法没收协议书若存在欺诈、胁迫、恶意串通等情形，导致合同内容违法或违背公序良俗，那么该协议书将被视为无效合同。无效合同自始没有法律约束力，因此非法没收的行为也就不具有合法性。
侵权责任角度：
- 非法没收协议书若导致他人财物损失或人身伤害，还可能构成侵权行为。根据《民法典》中关于侵权责任的规定，侵权人需承担停止侵害、赔偿损失等民事责任。这意味着，非法没收的行为不仅可能面临合同无效的后果，还可能需对受害者进行经济赔偿。
法律建议：
- 若您遭遇非法没收协议书的情况，首先应保留好相关证据，如协议书、沟通记录、财物损失证明等。
- 接着，您可以尝试与对方协商，要求撤销非法没收行为并恢复原状或赔偿损失。
- 若协商无果，您可以向法院提起诉讼，要求确认协议书无效并追究对方的侵权责任。
可能法律后果：
- 非法没收协议书的行为一旦被确认违法，将面临合同无效、赔偿损失等法律后果。
- 在严重情况下，若非法没收行为构成犯罪（如盗窃罪、抢劫罪等），行为人还将面临刑事责任的追究。
综上所述，非法没收协议书违反了物权保护、合同效力以及侵权责任的相关法律规定。若您遇到此类情况，请务必保留好证据并及时寻求法律帮助。有问题可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。