结论：协议合同只有签名没有手印没有盖章，在一般情况下是有效的，但具体还需根据协议内容、当事人行为能力以及是否存在特殊约定等因素综合判断。

法律依据与分析

根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这一法律条款明确指出了签名、盖章和按指印三种方式在法律上具有同等的效力，都是合同成立的有效方式。因此，在一般情况下，只要协议内容真实、合法，且当事人具有相应的民事行为能力，即使协议上只有签名而没有手印或盖章，该协议也是有效的。

具体分析

1. 签名作为真实意思表示：

   • 签名是当事人真实意思表示的一种体现形式。只要协议内容是双方自愿协商达成的，不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方都具有相应的民事行为能力，那么即使协议上只有签名，该协议也是有效的。

2. 特殊情况的考量：

   • 在某些特殊情况下，如果当事人在协议中明确约定必须同时签字、盖章或按手印协议才生效，那么此时仅有签名而没有手印或盖章，协议可能不满足生效条件。因此，在签订协议时，应仔细阅读并理解协议中的全部条款，特别是关于生效条件的约定。
   • 另外，如果一方以欺诈、胁迫的手段订立协议，或者协议内容损害国家、集体或第三人的利益，或者违反法律、行政法规的强制性规定，那么该协议可能被认定为无效。

3. 增强协议有效性的建议：

   • 为了确保协议的法律效力和避免后续可能出现的纠纷，建议在签订协议时，最好还是按照法律规定的形式和要求来履行相关的手续，如签字、盖章或按手印等。这些方式都能在一定程度上增强协议的真实性和可信度。
   • 同时，应妥善保管好协议原件，以备不时之需。在协议执行过程中，如有任何疑问或争议，应及时寻求法律帮助，以便得到准确的解答和帮助。

实例说明

以甲和乙签订的房屋租赁合同为例，双方在合同上签字确认，虽然没有按手印或盖章，但只要这份合同是双方自愿协商达成的，租赁行为也不违反法律法规，那么这份合同就是有效的，对甲和乙都具有法律约束力。这进一步印证了签名在法律上的有效性以及手印或盖章并非合同成立的必要条件。

总结：协议合同只有签名没有手印没有盖章，在一般情况下是有效的。但为了确保协议的法律效力和避免纠纷，建议按照法律规定的形式和要求来签订和保管协议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。