面对被员工诬陷且没有直接证据的情况，确实是一个棘手的问题，但您可以通过一系列综合措施来维护自己的合法权益，并力求澄清事实。以下是我为您详细梳理的应对策略：

一、立即报警并详细阐述情况

首先，向公安机关报案是至关重要的。公安机关有专业的侦查手段和资源，能够搜集证据，查明事实真相。在报案时，请尽可能详细地描述被诬陷的经过，包括时间、地点、涉及人员等关键信息。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，捏造事实诬告陷害他人，意图使他人受刑事追究，情节严重的，将受到法律制裁。

二、积极搜集间接证据与寻找证人

尽管没有直接证据，但您可以尝试收集与被诬陷事件相关的间接证据。比如，消费记录、监控视频、通话记录等，这些都能证明您在所谓“犯罪时间”并不在现场或从事其他活动。同时，回忆事件发生时是否有其他人在场，并尝试找到这些人作为证人。他们的证言可能对查明事实起到关键作用。

三、妥善保存与诬陷相关的所有材料

请务必保存与诬陷有关的一切信息，如短信、微信聊天记录、电子邮件等。这些材料可能包含对您有利的线索，甚至能揭示对方的破绽。在保存这些材料时，建议进行备份，以防丢失或损坏。

四、向相关机关提出调查核实请求

除了报警外，您还可以向公安机关、纪律检查部门等相关机关如实陈述情况，并提出自己的诉求，要求他们对诬陷事件进行调查核实。在提出请求时，请提供您所掌握的所有线索和信息，以便相关机关能够更有效地开展调查工作。

五、考虑进行司法鉴定

如果诬陷涉及专业领域的问题，如文件真伪、笔迹鉴定等，您可以申请专业的司法鉴定。通过科学的鉴定方法，您可以获取更确凿的证据，以证明事实并非如对方所诬陷的那样。

六、通过法律途径维护自身权益

在必要时，您可以考虑聘请律师代理提起诉讼或提供法律咨询。律师将协助您收集证据，提供专业的法律意见，并帮助您制定合适的维权策略。如果诬陷行为对您的名誉、财产等造成了严重损害，您可以向法院提起民事诉讼，要求对方停止侵害、消除影响、恢复名誉、赔礼道歉并赔偿损失。如果诬陷行为情节严重，构成犯罪，您还可以向公安机关报案，追究对方的刑事责任。

七、向有关行政机关申诉

除了报警和提起诉讼外，您还可以向工商、民政、文化等相关部门投诉或举报。这些部门将根据各自的职责范围对申诉进行调查处理，并给予相应的回复。这有助于扩大您的维权渠道，增加解决问题的可能性。

八、保持冷静并了解相关法律法规

在面对诬陷时，保持冷静至关重要。避免采取过激行为，以免进一步损害自己的权益。同时，建议您熟悉《中华人民共和国刑法》、《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关法律法规，以便在维权过程中更好地保护自己的权益。

综上所述，被诬陷且没有直接证据时，您应积极寻求法律帮助，采取多种措施来维护自身权益。同时，保持冷静并配合相关机关的调查工作，以期待公正的处理结果。希望这些建议能对您有所帮助。